Protein–RNA interactions for Protein: Q66X05

Nlrp4f, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4fQ66X05 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nlrp4fQ66X05 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Nlrp4fQ66X05 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nlrp4fQ66X05 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Nlrp4fQ66X05 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Nlrp4fQ66X05 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nlrp4fQ66X05 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nlrp4fQ66X05 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nlrp4fQ66X05 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nlrp4fQ66X05 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nlrp4fQ66X05 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nlrp4fQ66X05 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nlrp4fQ66X05 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nlrp4fQ66X05 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nlrp4fQ66X05 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nlrp4fQ66X05 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nlrp4fQ66X05 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nlrp4fQ66X05 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nlrp4fQ66X05 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nlrp4fQ66X05 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nlrp4fQ66X05 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nlrp4fQ66X05 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nlrp4fQ66X05 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nlrp4fQ66X05 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Nlrp4fQ66X05 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nlrp4fQ66X05 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nlrp4fQ66X05 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nlrp4fQ66X05 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nlrp4fQ66X05 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nlrp4fQ66X05 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nlrp4fQ66X05 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nlrp4fQ66X05 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nlrp4fQ66X05 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nlrp4fQ66X05 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nlrp4fQ66X05 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nlrp4fQ66X05 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nlrp4fQ66X05 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nlrp4fQ66X05 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nlrp4fQ66X05 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nlrp4fQ66X05 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nlrp4fQ66X05 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Nlrp4fQ66X05 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nlrp4fQ66X05 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nlrp4fQ66X05 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nlrp4fQ66X05 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nlrp4fQ66X05 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nlrp4fQ66X05 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nlrp4fQ66X05 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nlrp4fQ66X05 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nlrp4fQ66X05 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nlrp4fQ66X05 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nlrp4fQ66X05 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nlrp4fQ66X05 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nlrp4fQ66X05 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nlrp4fQ66X05 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nlrp4fQ66X05 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nlrp4fQ66X05 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nlrp4fQ66X05 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nlrp4fQ66X05 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nlrp4fQ66X05 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nlrp4fQ66X05 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nlrp4fQ66X05 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nlrp4fQ66X05 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nlrp4fQ66X05 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nlrp4fQ66X05 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nlrp4fQ66X05 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nlrp4fQ66X05 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nlrp4fQ66X05 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nlrp4fQ66X05 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nlrp4fQ66X05 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nlrp4fQ66X05 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Nlrp4fQ66X05 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nlrp4fQ66X05 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nlrp4fQ66X05 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nlrp4fQ66X05 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nlrp4fQ66X05 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nlrp4fQ66X05 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nlrp4fQ66X05 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nlrp4fQ66X05 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nlrp4fQ66X05 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nlrp4fQ66X05 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nlrp4fQ66X05 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nlrp4fQ66X05 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Nlrp4fQ66X05 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nlrp4fQ66X05 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nlrp4fQ66X05 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nlrp4fQ66X05 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Nlrp4fQ66X05 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nlrp4fQ66X05 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nlrp4fQ66X05 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nlrp4fQ66X05 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nlrp4fQ66X05 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nlrp4fQ66X05 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nlrp4fQ66X05 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nlrp4fQ66X05 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nlrp4fQ66X05 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nlrp4fQ66X05 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nlrp4fQ66X05 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nlrp4fQ66X05 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nlrp4fQ66X05 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms