Protein–RNA interactions for Protein: Q64345

Ifit3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3Q64345 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ifit3Q64345 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ifit3Q64345 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ifit3Q64345 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ifit3Q64345 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ifit3Q64345 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ifit3Q64345 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ifit3Q64345 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ifit3Q64345 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ifit3Q64345 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ifit3Q64345 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ifit3Q64345 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ifit3Q64345 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ifit3Q64345 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ifit3Q64345 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ifit3Q64345 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ifit3Q64345 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ifit3Q64345 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ifit3Q64345 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ifit3Q64345 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ifit3Q64345 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ifit3Q64345 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ifit3Q64345 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ifit3Q64345 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ifit3Q64345 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ifit3Q64345 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ifit3Q64345 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ifit3Q64345 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ifit3Q64345 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ifit3Q64345 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ifit3Q64345 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ifit3Q64345 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ifit3Q64345 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ifit3Q64345 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ifit3Q64345 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ifit3Q64345 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ifit3Q64345 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ifit3Q64345 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ifit3Q64345 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ifit3Q64345 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ifit3Q64345 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ifit3Q64345 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ifit3Q64345 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ifit3Q64345 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ifit3Q64345 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ifit3Q64345 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ifit3Q64345 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ifit3Q64345 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ifit3Q64345 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ifit3Q64345 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ifit3Q64345 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ifit3Q64345 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ifit3Q64345 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ifit3Q64345 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ifit3Q64345 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ifit3Q64345 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ifit3Q64345 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ifit3Q64345 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ifit3Q64345 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ifit3Q64345 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ifit3Q64345 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ifit3Q64345 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ifit3Q64345 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ifit3Q64345 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ifit3Q64345 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ifit3Q64345 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ifit3Q64345 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ifit3Q64345 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ifit3Q64345 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ifit3Q64345 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ifit3Q64345 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ifit3Q64345 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ifit3Q64345 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ifit3Q64345 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ifit3Q64345 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ifit3Q64345 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ifit3Q64345 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ifit3Q64345 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ifit3Q64345 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ifit3Q64345 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ifit3Q64345 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ifit3Q64345 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ifit3Q64345 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ifit3Q64345 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ifit3Q64345 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ifit3Q64345 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ifit3Q64345 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ifit3Q64345 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ifit3Q64345 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ifit3Q64345 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ifit3Q64345 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ifit3Q64345 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ifit3Q64345 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ifit3Q64345 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ifit3Q64345 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ifit3Q64345 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ifit3Q64345 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ifit3Q64345 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ifit3Q64345 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ifit3Q64345 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms