Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Krt12Q64291 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Krt12Q64291 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Krt12Q64291 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Krt12Q64291 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Krt12Q64291 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Krt12Q64291 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Krt12Q64291 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Krt12Q64291 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Krt12Q64291 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Krt12Q64291 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Krt12Q64291 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Krt12Q64291 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Krt12Q64291 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Krt12Q64291 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Krt12Q64291 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Krt12Q64291 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Krt12Q64291 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Krt12Q64291 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Krt12Q64291 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Krt12Q64291 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Krt12Q64291 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Krt12Q64291 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Krt12Q64291 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Krt12Q64291 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Krt12Q64291 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Krt12Q64291 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Krt12Q64291 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Krt12Q64291 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Krt12Q64291 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Krt12Q64291 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Krt12Q64291 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Krt12Q64291 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Krt12Q64291 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Krt12Q64291 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Krt12Q64291 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Krt12Q64291 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Krt12Q64291 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Krt12Q64291 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Krt12Q64291 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Krt12Q64291 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Krt12Q64291 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Krt12Q64291 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Krt12Q64291 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Krt12Q64291 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Krt12Q64291 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Krt12Q64291 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Krt12Q64291 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Krt12Q64291 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Krt12Q64291 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Krt12Q64291 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Krt12Q64291 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Krt12Q64291 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Krt12Q64291 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Krt12Q64291 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Krt12Q64291 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Krt12Q64291 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Krt12Q64291 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Krt12Q64291 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Krt12Q64291 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Krt12Q64291 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Krt12Q64291 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Krt12Q64291 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krt12Q64291 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krt12Q64291 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Krt12Q64291 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Krt12Q64291 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Krt12Q64291 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Krt12Q64291 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Krt12Q64291 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Krt12Q64291 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Krt12Q64291 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Krt12Q64291 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Krt12Q64291 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Krt12Q64291 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Krt12Q64291 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Krt12Q64291 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Krt12Q64291 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Krt12Q64291 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Krt12Q64291 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Krt12Q64291 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Krt12Q64291 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Krt12Q64291 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt12Q64291 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt12Q64291 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt12Q64291 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt12Q64291 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt12Q64291 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Krt12Q64291 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Krt12Q64291 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt12Q64291 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt12Q64291 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Krt12Q64291 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Krt12Q64291 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt12Q64291 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Krt12Q64291 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Krt12Q64291 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
Krt12Q64291 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Krt12Q64291 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Krt12Q64291 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms