Protein–RNA interactions for Protein: Q64104

Nr2e1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e1Q64104 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nr2e1Q64104 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nr2e1Q64104 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nr2e1Q64104 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nr2e1Q64104 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nr2e1Q64104 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nr2e1Q64104 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nr2e1Q64104 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nr2e1Q64104 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nr2e1Q64104 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nr2e1Q64104 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nr2e1Q64104 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nr2e1Q64104 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Nr2e1Q64104 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nr2e1Q64104 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nr2e1Q64104 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nr2e1Q64104 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nr2e1Q64104 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nr2e1Q64104 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nr2e1Q64104 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nr2e1Q64104 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nr2e1Q64104 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nr2e1Q64104 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nr2e1Q64104 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nr2e1Q64104 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nr2e1Q64104 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nr2e1Q64104 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Nr2e1Q64104 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nr2e1Q64104 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nr2e1Q64104 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nr2e1Q64104 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nr2e1Q64104 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nr2e1Q64104 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nr2e1Q64104 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nr2e1Q64104 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nr2e1Q64104 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nr2e1Q64104 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nr2e1Q64104 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nr2e1Q64104 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nr2e1Q64104 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nr2e1Q64104 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nr2e1Q64104 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nr2e1Q64104 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nr2e1Q64104 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nr2e1Q64104 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nr2e1Q64104 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nr2e1Q64104 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nr2e1Q64104 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nr2e1Q64104 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nr2e1Q64104 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nr2e1Q64104 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nr2e1Q64104 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nr2e1Q64104 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nr2e1Q64104 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nr2e1Q64104 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nr2e1Q64104 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nr2e1Q64104 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Nr2e1Q64104 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nr2e1Q64104 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nr2e1Q64104 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nr2e1Q64104 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nr2e1Q64104 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nr2e1Q64104 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Nr2e1Q64104 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nr2e1Q64104 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nr2e1Q64104 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nr2e1Q64104 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nr2e1Q64104 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nr2e1Q64104 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nr2e1Q64104 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nr2e1Q64104 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nr2e1Q64104 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nr2e1Q64104 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nr2e1Q64104 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nr2e1Q64104 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Nr2e1Q64104 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Nr2e1Q64104 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Nr2e1Q64104 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nr2e1Q64104 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nr2e1Q64104 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nr2e1Q64104 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nr2e1Q64104 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Nr2e1Q64104 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nr2e1Q64104 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nr2e1Q64104 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nr2e1Q64104 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nr2e1Q64104 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nr2e1Q64104 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Nr2e1Q64104 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nr2e1Q64104 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nr2e1Q64104 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nr2e1Q64104 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nr2e1Q64104 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nr2e1Q64104 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nr2e1Q64104 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nr2e1Q64104 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nr2e1Q64104 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nr2e1Q64104 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nr2e1Q64104 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nr2e1Q64104 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms