Protein–RNA interactions for Protein: Q640N2

Arl13b, ADP-ribosylation factor-like protein 13B, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl13bQ640N2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Arl13bQ640N2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Arl13bQ640N2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Arl13bQ640N2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Arl13bQ640N2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Arl13bQ640N2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Arl13bQ640N2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Arl13bQ640N2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Arl13bQ640N2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Arl13bQ640N2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Arl13bQ640N2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Arl13bQ640N2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Arl13bQ640N2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Arl13bQ640N2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Arl13bQ640N2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Arl13bQ640N2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Arl13bQ640N2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Arl13bQ640N2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Arl13bQ640N2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Arl13bQ640N2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Arl13bQ640N2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Arl13bQ640N2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Arl13bQ640N2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Arl13bQ640N2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Arl13bQ640N2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Arl13bQ640N2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Arl13bQ640N2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Arl13bQ640N2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Arl13bQ640N2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Arl13bQ640N2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Arl13bQ640N2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Arl13bQ640N2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Arl13bQ640N2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Arl13bQ640N2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Arl13bQ640N2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Arl13bQ640N2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Arl13bQ640N2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Arl13bQ640N2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Arl13bQ640N2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Arl13bQ640N2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Arl13bQ640N2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Arl13bQ640N2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Arl13bQ640N2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Arl13bQ640N2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Arl13bQ640N2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Arl13bQ640N2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Arl13bQ640N2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Arl13bQ640N2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Arl13bQ640N2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Arl13bQ640N2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Arl13bQ640N2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Arl13bQ640N2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Arl13bQ640N2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Arl13bQ640N2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Arl13bQ640N2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arl13bQ640N2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arl13bQ640N2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Arl13bQ640N2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Arl13bQ640N2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Arl13bQ640N2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arl13bQ640N2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arl13bQ640N2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arl13bQ640N2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arl13bQ640N2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arl13bQ640N2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arl13bQ640N2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arl13bQ640N2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Arl13bQ640N2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arl13bQ640N2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arl13bQ640N2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arl13bQ640N2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arl13bQ640N2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arl13bQ640N2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arl13bQ640N2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arl13bQ640N2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arl13bQ640N2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arl13bQ640N2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arl13bQ640N2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arl13bQ640N2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arl13bQ640N2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Arl13bQ640N2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Arl13bQ640N2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Arl13bQ640N2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Arl13bQ640N2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Arl13bQ640N2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Arl13bQ640N2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Arl13bQ640N2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Arl13bQ640N2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Arl13bQ640N2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Arl13bQ640N2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Arl13bQ640N2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Arl13bQ640N2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Arl13bQ640N2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Arl13bQ640N2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Arl13bQ640N2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Arl13bQ640N2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Arl13bQ640N2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Arl13bQ640N2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Arl13bQ640N2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Arl13bQ640N2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms