Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
Ccdc18Q640L5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
Ccdc18Q640L5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
Ccdc18Q640L5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC43.38■■■■■ 4.54
Ccdc18Q640L5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
Ccdc18Q640L5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.35■■■■■ 4.53
Ccdc18Q640L5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
Ccdc18Q640L5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC43.32■■■■■ 4.52
Ccdc18Q640L5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.52
Ccdc18Q640L5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
Ccdc18Q640L5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC43.28■■■■■ 4.52
Ccdc18Q640L5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC43.27■■■■■ 4.52
Ccdc18Q640L5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
Ccdc18Q640L5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
Ccdc18Q640L5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.22■■■■■ 4.51
Ccdc18Q640L5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
Ccdc18Q640L5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
Ccdc18Q640L5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.21■■■■■ 4.51
Ccdc18Q640L5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
Ccdc18Q640L5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
Ccdc18Q640L5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
Ccdc18Q640L5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
Ccdc18Q640L5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
Ccdc18Q640L5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.1■■■■■ 4.49
Ccdc18Q640L5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
Ccdc18Q640L5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.1■■■■■ 4.49
Ccdc18Q640L5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
Ccdc18Q640L5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
Ccdc18Q640L5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC43.03■■■■■ 4.48
Ccdc18Q640L5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.03■■■■■ 4.48
Ccdc18Q640L5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
Ccdc18Q640L5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
Ccdc18Q640L5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC42.91■■■■■ 4.46
Ccdc18Q640L5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC42.91■■■■■ 4.46
Ccdc18Q640L5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.91■■■■■ 4.46
Ccdc18Q640L5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.89■■■■■ 4.46
Ccdc18Q640L5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC42.89■■■■■ 4.46
Ccdc18Q640L5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC42.88■■■■■ 4.45
Ccdc18Q640L5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
Ccdc18Q640L5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC42.87■■■■■ 4.45
Ccdc18Q640L5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.86■■■■■ 4.45
Ccdc18Q640L5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
Ccdc18Q640L5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
Ccdc18Q640L5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
Ccdc18Q640L5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
Ccdc18Q640L5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
Ccdc18Q640L5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
Ccdc18Q640L5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC42.82■■■■■ 4.45
Ccdc18Q640L5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC42.8■■■■■ 4.44
Ccdc18Q640L5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC42.79■■■■■ 4.44
Ccdc18Q640L5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
Ccdc18Q640L5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.43
Ccdc18Q640L5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC42.75■■■■■ 4.43
Ccdc18Q640L5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
Ccdc18Q640L5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC42.73■■■■■ 4.43
Ccdc18Q640L5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
Ccdc18Q640L5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
Ccdc18Q640L5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC42.7■■■■■ 4.43
Ccdc18Q640L5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
Ccdc18Q640L5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
Ccdc18Q640L5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
Ccdc18Q640L5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
Ccdc18Q640L5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
Ccdc18Q640L5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
Ccdc18Q640L5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC42.6■■■■■ 4.41
Ccdc18Q640L5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC42.58■■■■■ 4.41
Ccdc18Q640L5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
Ccdc18Q640L5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.4
Ccdc18Q640L5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC42.55■■■■■ 4.4
Ccdc18Q640L5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.54■■■■■ 4.4
Ccdc18Q640L5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
Ccdc18Q640L5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
Ccdc18Q640L5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC42.53■■■■■ 4.4
Ccdc18Q640L5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC42.52■■■■■ 4.4
Ccdc18Q640L5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
Ccdc18Q640L5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC42.5■■■■■ 4.39
Ccdc18Q640L5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC42.5■■■■■ 4.39
Ccdc18Q640L5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC42.48■■■■■ 4.39
Ccdc18Q640L5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
Ccdc18Q640L5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.46■■■■■ 4.39
Ccdc18Q640L5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
Ccdc18Q640L5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.46■■■■■ 4.39
Ccdc18Q640L5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC42.46■■■■■ 4.39
Ccdc18Q640L5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
Ccdc18Q640L5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
Ccdc18Q640L5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
Ccdc18Q640L5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
Ccdc18Q640L5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
Ccdc18Q640L5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
Ccdc18Q640L5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
Ccdc18Q640L5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
Ccdc18Q640L5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC42.42■■■■■ 4.38
Ccdc18Q640L5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
Ccdc18Q640L5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
Ccdc18Q640L5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
Ccdc18Q640L5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
Ccdc18Q640L5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
Ccdc18Q640L5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.36■■■■■ 4.37
Ccdc18Q640L5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
Ccdc18Q640L5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC42.33■■■■■ 4.37
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