Protein–RNA interactions for Protein: Q64028

Phc1, Polyhomeotic-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc1Q64028 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Phc1Q64028 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Phc1Q64028 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Phc1Q64028 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Phc1Q64028 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Phc1Q64028 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Phc1Q64028 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Phc1Q64028 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Phc1Q64028 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Phc1Q64028 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Phc1Q64028 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Phc1Q64028 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Phc1Q64028 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Phc1Q64028 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Phc1Q64028 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Phc1Q64028 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Phc1Q64028 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Phc1Q64028 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Phc1Q64028 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Phc1Q64028 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Phc1Q64028 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Phc1Q64028 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Phc1Q64028 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Phc1Q64028 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Phc1Q64028 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Phc1Q64028 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Phc1Q64028 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Phc1Q64028 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Phc1Q64028 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Phc1Q64028 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Phc1Q64028 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Phc1Q64028 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Phc1Q64028 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Phc1Q64028 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Phc1Q64028 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Phc1Q64028 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Phc1Q64028 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Phc1Q64028 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Phc1Q64028 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Phc1Q64028 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Phc1Q64028 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Phc1Q64028 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Phc1Q64028 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Phc1Q64028 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Phc1Q64028 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Phc1Q64028 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Phc1Q64028 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Phc1Q64028 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Phc1Q64028 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Phc1Q64028 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Phc1Q64028 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Phc1Q64028 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Phc1Q64028 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Phc1Q64028 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Phc1Q64028 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Phc1Q64028 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Phc1Q64028 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Phc1Q64028 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Phc1Q64028 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Phc1Q64028 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Phc1Q64028 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Phc1Q64028 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Phc1Q64028 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Phc1Q64028 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Phc1Q64028 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Phc1Q64028 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Phc1Q64028 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Phc1Q64028 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Phc1Q64028 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Phc1Q64028 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Phc1Q64028 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Phc1Q64028 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Phc1Q64028 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Phc1Q64028 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Phc1Q64028 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Phc1Q64028 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Phc1Q64028 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Phc1Q64028 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Phc1Q64028 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Phc1Q64028 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Phc1Q64028 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Phc1Q64028 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Phc1Q64028 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Phc1Q64028 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Phc1Q64028 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Phc1Q64028 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Phc1Q64028 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Phc1Q64028 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Phc1Q64028 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Phc1Q64028 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Phc1Q64028 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Phc1Q64028 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Phc1Q64028 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Phc1Q64028 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Phc1Q64028 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Phc1Q64028 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Phc1Q64028 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Phc1Q64028 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Phc1Q64028 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Phc1Q64028 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms