Protein–RNA interactions for Protein: Q64028

Phc1, Polyhomeotic-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc1Q64028 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25,9■■□□□ 1,74
Phc1Q64028 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Phc1Q64028 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Phc1Q64028 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Phc1Q64028 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Phc1Q64028 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25,88■■□□□ 1,73
Phc1Q64028 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Phc1Q64028 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Phc1Q64028 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25,83■■□□□ 1,73
Phc1Q64028 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Phc1Q64028 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Phc1Q64028 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25,82■■□□□ 1,72
Phc1Q64028 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Phc1Q64028 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Phc1Q64028 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25,81■■□□□ 1,72
Phc1Q64028 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Phc1Q64028 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Phc1Q64028 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Phc1Q64028 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Phc1Q64028 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Phc1Q64028 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Phc1Q64028 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,77■■□□□ 1,72
Phc1Q64028 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Phc1Q64028 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Phc1Q64028 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,75■■□□□ 1,71
Phc1Q64028 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25,75■■□□□ 1,71
Phc1Q64028 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25,74■■□□□ 1,71
Phc1Q64028 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Phc1Q64028 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25,7■■□□□ 1,7
Phc1Q64028 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,69■■□□□ 1,7
Phc1Q64028 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25,69■■□□□ 1,7
Phc1Q64028 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,69■■□□□ 1,7
Phc1Q64028 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Phc1Q64028 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25,68■■□□□ 1,7
Phc1Q64028 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,68■■□□□ 1,7
Phc1Q64028 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,67■■□□□ 1,7
Phc1Q64028 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Phc1Q64028 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Phc1Q64028 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Phc1Q64028 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,67■■□□□ 1,7
Phc1Q64028 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,65■■□□□ 1,7
Phc1Q64028 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Phc1Q64028 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,69
Phc1Q64028 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Phc1Q64028 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Phc1Q64028 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Phc1Q64028 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Phc1Q64028 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Phc1Q64028 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Phc1Q64028 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25,6■■□□□ 1,69
Phc1Q64028 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Phc1Q64028 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Phc1Q64028 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Phc1Q64028 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25,58■■□□□ 1,68
Phc1Q64028 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Phc1Q64028 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Phc1Q64028 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Phc1Q64028 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Phc1Q64028 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Phc1Q64028 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Phc1Q64028 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25,55■■□□□ 1,68
Phc1Q64028 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25,55■■□□□ 1,68
Phc1Q64028 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Phc1Q64028 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,55■■□□□ 1,68
Phc1Q64028 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Phc1Q64028 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Phc1Q64028 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Phc1Q64028 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25,52■■□□□ 1,68
Phc1Q64028 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Phc1Q64028 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Phc1Q64028 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Phc1Q64028 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Phc1Q64028 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Phc1Q64028 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Phc1Q64028 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Phc1Q64028 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Phc1Q64028 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Phc1Q64028 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Phc1Q64028 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Phc1Q64028 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Phc1Q64028 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Phc1Q64028 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Phc1Q64028 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Phc1Q64028 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,45■■□□□ 1,66
Phc1Q64028 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25,44■■□□□ 1,66
Phc1Q64028 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Phc1Q64028 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Phc1Q64028 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Phc1Q64028 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Phc1Q64028 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Phc1Q64028 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Phc1Q64028 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Phc1Q64028 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Phc1Q64028 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Phc1Q64028 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Phc1Q64028 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Phc1Q64028 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Phc1Q64028 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Phc1Q64028 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Phc1Q64028 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,1 ms