Protein–RNA interactions for Protein: Q62417

Sorbs1, Sorbin and SH3 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs1Q62417 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sorbs1Q62417 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sorbs1Q62417 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Sorbs1Q62417 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sorbs1Q62417 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sorbs1Q62417 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sorbs1Q62417 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sorbs1Q62417 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sorbs1Q62417 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sorbs1Q62417 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sorbs1Q62417 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sorbs1Q62417 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sorbs1Q62417 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sorbs1Q62417 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Sorbs1Q62417 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sorbs1Q62417 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sorbs1Q62417 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sorbs1Q62417 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sorbs1Q62417 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sorbs1Q62417 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sorbs1Q62417 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sorbs1Q62417 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sorbs1Q62417 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sorbs1Q62417 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sorbs1Q62417 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sorbs1Q62417 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sorbs1Q62417 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sorbs1Q62417 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sorbs1Q62417 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sorbs1Q62417 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sorbs1Q62417 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sorbs1Q62417 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sorbs1Q62417 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sorbs1Q62417 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sorbs1Q62417 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sorbs1Q62417 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sorbs1Q62417 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sorbs1Q62417 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sorbs1Q62417 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sorbs1Q62417 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Sorbs1Q62417 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Sorbs1Q62417 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sorbs1Q62417 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sorbs1Q62417 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sorbs1Q62417 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Sorbs1Q62417 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sorbs1Q62417 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Sorbs1Q62417 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sorbs1Q62417 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sorbs1Q62417 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sorbs1Q62417 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Sorbs1Q62417 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sorbs1Q62417 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sorbs1Q62417 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sorbs1Q62417 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sorbs1Q62417 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sorbs1Q62417 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sorbs1Q62417 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Sorbs1Q62417 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sorbs1Q62417 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sorbs1Q62417 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sorbs1Q62417 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sorbs1Q62417 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sorbs1Q62417 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sorbs1Q62417 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sorbs1Q62417 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sorbs1Q62417 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sorbs1Q62417 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sorbs1Q62417 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sorbs1Q62417 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sorbs1Q62417 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sorbs1Q62417 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sorbs1Q62417 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sorbs1Q62417 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sorbs1Q62417 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sorbs1Q62417 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sorbs1Q62417 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sorbs1Q62417 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sorbs1Q62417 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sorbs1Q62417 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sorbs1Q62417 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sorbs1Q62417 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sorbs1Q62417 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sorbs1Q62417 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sorbs1Q62417 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sorbs1Q62417 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sorbs1Q62417 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sorbs1Q62417 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sorbs1Q62417 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sorbs1Q62417 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sorbs1Q62417 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sorbs1Q62417 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sorbs1Q62417 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sorbs1Q62417 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sorbs1Q62417 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sorbs1Q62417 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Sorbs1Q62417 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sorbs1Q62417 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sorbs1Q62417 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sorbs1Q62417 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms