Protein–RNA interactions for Protein: Q62413

Epha6, Ephrin type-A receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha6Q62413 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Epha6Q62413 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Epha6Q62413 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Epha6Q62413 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Epha6Q62413 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Epha6Q62413 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Epha6Q62413 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Epha6Q62413 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Epha6Q62413 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Epha6Q62413 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Epha6Q62413 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Epha6Q62413 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Epha6Q62413 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Epha6Q62413 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Epha6Q62413 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Epha6Q62413 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Epha6Q62413 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Epha6Q62413 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Epha6Q62413 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Epha6Q62413 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Epha6Q62413 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Epha6Q62413 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Epha6Q62413 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Epha6Q62413 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Epha6Q62413 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Epha6Q62413 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Epha6Q62413 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Epha6Q62413 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Epha6Q62413 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Epha6Q62413 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Epha6Q62413 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Epha6Q62413 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Epha6Q62413 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Epha6Q62413 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Epha6Q62413 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Epha6Q62413 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Epha6Q62413 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Epha6Q62413 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Epha6Q62413 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Epha6Q62413 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Epha6Q62413 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Epha6Q62413 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Epha6Q62413 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Epha6Q62413 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Epha6Q62413 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Epha6Q62413 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Epha6Q62413 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Epha6Q62413 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Epha6Q62413 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Epha6Q62413 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Epha6Q62413 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Epha6Q62413 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Epha6Q62413 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Epha6Q62413 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Epha6Q62413 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Epha6Q62413 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Epha6Q62413 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Epha6Q62413 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Epha6Q62413 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Epha6Q62413 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Epha6Q62413 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Epha6Q62413 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Epha6Q62413 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Epha6Q62413 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Epha6Q62413 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Epha6Q62413 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Epha6Q62413 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Epha6Q62413 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Epha6Q62413 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Epha6Q62413 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Epha6Q62413 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Epha6Q62413 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Epha6Q62413 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Epha6Q62413 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Epha6Q62413 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Epha6Q62413 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Epha6Q62413 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Epha6Q62413 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Epha6Q62413 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Epha6Q62413 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Epha6Q62413 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Epha6Q62413 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Epha6Q62413 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Epha6Q62413 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Epha6Q62413 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Epha6Q62413 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Epha6Q62413 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Epha6Q62413 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Epha6Q62413 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Epha6Q62413 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Epha6Q62413 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Epha6Q62413 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Epha6Q62413 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Epha6Q62413 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Epha6Q62413 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Epha6Q62413 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Epha6Q62413 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Epha6Q62413 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Epha6Q62413 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Epha6Q62413 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms