Protein–RNA interactions for Protein: Q62266

Sprr1a, Cornifin-A, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1aQ62266 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sprr1aQ62266 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sprr1aQ62266 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sprr1aQ62266 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sprr1aQ62266 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sprr1aQ62266 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sprr1aQ62266 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sprr1aQ62266 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sprr1aQ62266 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sprr1aQ62266 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sprr1aQ62266 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sprr1aQ62266 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sprr1aQ62266 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sprr1aQ62266 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sprr1aQ62266 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sprr1aQ62266 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sprr1aQ62266 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sprr1aQ62266 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sprr1aQ62266 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sprr1aQ62266 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sprr1aQ62266 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sprr1aQ62266 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sprr1aQ62266 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sprr1aQ62266 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sprr1aQ62266 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sprr1aQ62266 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sprr1aQ62266 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sprr1aQ62266 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sprr1aQ62266 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sprr1aQ62266 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sprr1aQ62266 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sprr1aQ62266 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sprr1aQ62266 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sprr1aQ62266 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sprr1aQ62266 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sprr1aQ62266 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sprr1aQ62266 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sprr1aQ62266 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sprr1aQ62266 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sprr1aQ62266 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sprr1aQ62266 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sprr1aQ62266 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sprr1aQ62266 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sprr1aQ62266 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sprr1aQ62266 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sprr1aQ62266 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sprr1aQ62266 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sprr1aQ62266 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sprr1aQ62266 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sprr1aQ62266 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sprr1aQ62266 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sprr1aQ62266 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sprr1aQ62266 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sprr1aQ62266 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sprr1aQ62266 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sprr1aQ62266 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sprr1aQ62266 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sprr1aQ62266 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sprr1aQ62266 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sprr1aQ62266 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sprr1aQ62266 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sprr1aQ62266 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sprr1aQ62266 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sprr1aQ62266 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sprr1aQ62266 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sprr1aQ62266 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sprr1aQ62266 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sprr1aQ62266 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sprr1aQ62266 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sprr1aQ62266 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sprr1aQ62266 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sprr1aQ62266 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sprr1aQ62266 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sprr1aQ62266 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sprr1aQ62266 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sprr1aQ62266 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sprr1aQ62266 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sprr1aQ62266 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sprr1aQ62266 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sprr1aQ62266 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sprr1aQ62266 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sprr1aQ62266 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sprr1aQ62266 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sprr1aQ62266 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sprr1aQ62266 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sprr1aQ62266 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sprr1aQ62266 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sprr1aQ62266 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sprr1aQ62266 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sprr1aQ62266 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sprr1aQ62266 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sprr1aQ62266 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sprr1aQ62266 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sprr1aQ62266 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sprr1aQ62266 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sprr1aQ62266 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sprr1aQ62266 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sprr1aQ62266 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sprr1aQ62266 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sprr1aQ62266 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms