Protein–RNA interactions for Protein: Q62217

Sema5a, Semaphorin-5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5aQ62217 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sema5aQ62217 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sema5aQ62217 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sema5aQ62217 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sema5aQ62217 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sema5aQ62217 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sema5aQ62217 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sema5aQ62217 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sema5aQ62217 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sema5aQ62217 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Sema5aQ62217 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sema5aQ62217 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sema5aQ62217 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sema5aQ62217 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sema5aQ62217 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sema5aQ62217 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Sema5aQ62217 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sema5aQ62217 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sema5aQ62217 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sema5aQ62217 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Sema5aQ62217 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sema5aQ62217 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sema5aQ62217 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sema5aQ62217 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sema5aQ62217 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sema5aQ62217 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sema5aQ62217 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sema5aQ62217 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sema5aQ62217 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sema5aQ62217 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sema5aQ62217 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sema5aQ62217 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sema5aQ62217 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Sema5aQ62217 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sema5aQ62217 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sema5aQ62217 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sema5aQ62217 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sema5aQ62217 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sema5aQ62217 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sema5aQ62217 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Sema5aQ62217 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Sema5aQ62217 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sema5aQ62217 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sema5aQ62217 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sema5aQ62217 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sema5aQ62217 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sema5aQ62217 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sema5aQ62217 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sema5aQ62217 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sema5aQ62217 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Sema5aQ62217 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Sema5aQ62217 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sema5aQ62217 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sema5aQ62217 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sema5aQ62217 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sema5aQ62217 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sema5aQ62217 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sema5aQ62217 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Sema5aQ62217 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sema5aQ62217 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sema5aQ62217 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sema5aQ62217 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sema5aQ62217 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sema5aQ62217 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sema5aQ62217 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sema5aQ62217 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sema5aQ62217 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sema5aQ62217 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sema5aQ62217 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sema5aQ62217 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sema5aQ62217 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sema5aQ62217 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sema5aQ62217 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sema5aQ62217 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sema5aQ62217 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sema5aQ62217 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sema5aQ62217 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sema5aQ62217 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sema5aQ62217 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sema5aQ62217 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sema5aQ62217 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sema5aQ62217 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sema5aQ62217 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sema5aQ62217 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sema5aQ62217 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sema5aQ62217 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sema5aQ62217 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sema5aQ62217 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sema5aQ62217 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sema5aQ62217 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sema5aQ62217 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sema5aQ62217 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sema5aQ62217 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sema5aQ62217 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sema5aQ62217 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sema5aQ62217 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sema5aQ62217 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sema5aQ62217 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sema5aQ62217 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sema5aQ62217 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms