Protein–RNA interactions for Protein: Q62059

Vcan, Versican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcanQ62059 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
VcanQ62059 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VcanQ62059 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VcanQ62059 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VcanQ62059 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VcanQ62059 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VcanQ62059 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VcanQ62059 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
VcanQ62059 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VcanQ62059 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VcanQ62059 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VcanQ62059 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VcanQ62059 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VcanQ62059 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VcanQ62059 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VcanQ62059 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
VcanQ62059 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VcanQ62059 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VcanQ62059 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VcanQ62059 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VcanQ62059 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VcanQ62059 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VcanQ62059 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
VcanQ62059 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VcanQ62059 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VcanQ62059 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VcanQ62059 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VcanQ62059 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VcanQ62059 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VcanQ62059 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VcanQ62059 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VcanQ62059 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VcanQ62059 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VcanQ62059 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VcanQ62059 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VcanQ62059 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VcanQ62059 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VcanQ62059 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VcanQ62059 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VcanQ62059 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VcanQ62059 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VcanQ62059 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VcanQ62059 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VcanQ62059 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VcanQ62059 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VcanQ62059 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VcanQ62059 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VcanQ62059 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VcanQ62059 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VcanQ62059 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VcanQ62059 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VcanQ62059 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
VcanQ62059 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VcanQ62059 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VcanQ62059 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VcanQ62059 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VcanQ62059 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
VcanQ62059 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VcanQ62059 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VcanQ62059 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
VcanQ62059 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VcanQ62059 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VcanQ62059 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VcanQ62059 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
VcanQ62059 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VcanQ62059 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VcanQ62059 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VcanQ62059 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VcanQ62059 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
VcanQ62059 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VcanQ62059 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VcanQ62059 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VcanQ62059 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VcanQ62059 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VcanQ62059 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VcanQ62059 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VcanQ62059 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VcanQ62059 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VcanQ62059 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VcanQ62059 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VcanQ62059 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VcanQ62059 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VcanQ62059 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VcanQ62059 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VcanQ62059 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VcanQ62059 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VcanQ62059 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VcanQ62059 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VcanQ62059 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VcanQ62059 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VcanQ62059 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
VcanQ62059 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VcanQ62059 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VcanQ62059 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VcanQ62059 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VcanQ62059 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VcanQ62059 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VcanQ62059 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VcanQ62059 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VcanQ62059 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms