Protein–RNA interactions for Protein: Q61789

Lama3, Laminin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 3,330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama3Q61789 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Lama3Q61789 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lama3Q61789 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lama3Q61789 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lama3Q61789 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Lama3Q61789 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Lama3Q61789 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lama3Q61789 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lama3Q61789 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lama3Q61789 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lama3Q61789 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lama3Q61789 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Lama3Q61789 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lama3Q61789 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lama3Q61789 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lama3Q61789 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lama3Q61789 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lama3Q61789 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lama3Q61789 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lama3Q61789 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lama3Q61789 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lama3Q61789 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lama3Q61789 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lama3Q61789 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lama3Q61789 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Lama3Q61789 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lama3Q61789 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lama3Q61789 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lama3Q61789 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lama3Q61789 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Lama3Q61789 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lama3Q61789 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lama3Q61789 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Lama3Q61789 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lama3Q61789 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Lama3Q61789 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Lama3Q61789 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Lama3Q61789 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Lama3Q61789 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lama3Q61789 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lama3Q61789 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lama3Q61789 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lama3Q61789 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lama3Q61789 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lama3Q61789 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lama3Q61789 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lama3Q61789 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lama3Q61789 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lama3Q61789 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lama3Q61789 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Lama3Q61789 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lama3Q61789 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Lama3Q61789 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lama3Q61789 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lama3Q61789 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lama3Q61789 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lama3Q61789 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lama3Q61789 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lama3Q61789 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lama3Q61789 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lama3Q61789 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lama3Q61789 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Lama3Q61789 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lama3Q61789 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lama3Q61789 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lama3Q61789 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lama3Q61789 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lama3Q61789 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lama3Q61789 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lama3Q61789 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lama3Q61789 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lama3Q61789 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Lama3Q61789 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lama3Q61789 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lama3Q61789 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Lama3Q61789 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lama3Q61789 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lama3Q61789 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lama3Q61789 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lama3Q61789 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lama3Q61789 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lama3Q61789 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lama3Q61789 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lama3Q61789 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lama3Q61789 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lama3Q61789 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lama3Q61789 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lama3Q61789 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Lama3Q61789 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lama3Q61789 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lama3Q61789 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lama3Q61789 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lama3Q61789 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lama3Q61789 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lama3Q61789 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lama3Q61789 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lama3Q61789 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lama3Q61789 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Lama3Q61789 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Lama3Q61789 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms