Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Itga6Q61739 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Itga6Q61739 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Itga6Q61739 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Itga6Q61739 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Itga6Q61739 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Itga6Q61739 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Itga6Q61739 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Itga6Q61739 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Itga6Q61739 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Itga6Q61739 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Itga6Q61739 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Itga6Q61739 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Itga6Q61739 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Itga6Q61739 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Itga6Q61739 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Itga6Q61739 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Itga6Q61739 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Itga6Q61739 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Itga6Q61739 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Itga6Q61739 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Itga6Q61739 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Itga6Q61739 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Itga6Q61739 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Itga6Q61739 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
Itga6Q61739 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Itga6Q61739 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
Itga6Q61739 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Itga6Q61739 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Itga6Q61739 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Itga6Q61739 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Itga6Q61739 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Itga6Q61739 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Itga6Q61739 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Itga6Q61739 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Itga6Q61739 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Itga6Q61739 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Itga6Q61739 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Itga6Q61739 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Itga6Q61739 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Itga6Q61739 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Itga6Q61739 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Itga6Q61739 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Itga6Q61739 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Itga6Q61739 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Itga6Q61739 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Itga6Q61739 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Itga6Q61739 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Itga6Q61739 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
Itga6Q61739 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Itga6Q61739 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Itga6Q61739 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Itga6Q61739 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Itga6Q61739 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Itga6Q61739 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Itga6Q61739 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Itga6Q61739 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Itga6Q61739 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Itga6Q61739 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Itga6Q61739 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Itga6Q61739 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Itga6Q61739 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Itga6Q61739 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Itga6Q61739 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Itga6Q61739 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Itga6Q61739 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Itga6Q61739 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Itga6Q61739 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Itga6Q61739 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Itga6Q61739 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Itga6Q61739 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Itga6Q61739 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Itga6Q61739 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Itga6Q61739 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Itga6Q61739 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Itga6Q61739 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Itga6Q61739 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Itga6Q61739 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Itga6Q61739 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Itga6Q61739 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Itga6Q61739 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Itga6Q61739 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Itga6Q61739 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
Itga6Q61739 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Itga6Q61739 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Itga6Q61739 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Itga6Q61739 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Itga6Q61739 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Itga6Q61739 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Itga6Q61739 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Itga6Q61739 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Itga6Q61739 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Itga6Q61739 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Itga6Q61739 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Itga6Q61739 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Itga6Q61739 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Itga6Q61739 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Itga6Q61739 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Itga6Q61739 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Itga6Q61739 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms