Protein–RNA interactions for Protein: Q61501

E2f1, Transcription factor E2F1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f1Q61501 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
E2f1Q61501 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E2f1Q61501 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
E2f1Q61501 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
E2f1Q61501 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
E2f1Q61501 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
E2f1Q61501 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
E2f1Q61501 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
E2f1Q61501 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
E2f1Q61501 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
E2f1Q61501 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
E2f1Q61501 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
E2f1Q61501 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
E2f1Q61501 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
E2f1Q61501 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
E2f1Q61501 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
E2f1Q61501 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
E2f1Q61501 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
E2f1Q61501 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
E2f1Q61501 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
E2f1Q61501 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
E2f1Q61501 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E2f1Q61501 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E2f1Q61501 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
E2f1Q61501 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E2f1Q61501 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
E2f1Q61501 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E2f1Q61501 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
E2f1Q61501 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
E2f1Q61501 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E2f1Q61501 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E2f1Q61501 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
E2f1Q61501 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E2f1Q61501 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
E2f1Q61501 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
E2f1Q61501 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
E2f1Q61501 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
E2f1Q61501 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
E2f1Q61501 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
E2f1Q61501 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
E2f1Q61501 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E2f1Q61501 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E2f1Q61501 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E2f1Q61501 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E2f1Q61501 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E2f1Q61501 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
E2f1Q61501 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
E2f1Q61501 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
E2f1Q61501 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E2f1Q61501 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
E2f1Q61501 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E2f1Q61501 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E2f1Q61501 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E2f1Q61501 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E2f1Q61501 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E2f1Q61501 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E2f1Q61501 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
E2f1Q61501 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E2f1Q61501 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
E2f1Q61501 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E2f1Q61501 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E2f1Q61501 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
E2f1Q61501 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
E2f1Q61501 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
E2f1Q61501 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
E2f1Q61501 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
E2f1Q61501 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
E2f1Q61501 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E2f1Q61501 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E2f1Q61501 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
E2f1Q61501 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
E2f1Q61501 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
E2f1Q61501 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
E2f1Q61501 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E2f1Q61501 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
E2f1Q61501 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
E2f1Q61501 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
E2f1Q61501 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
E2f1Q61501 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
E2f1Q61501 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
E2f1Q61501 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
E2f1Q61501 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
E2f1Q61501 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
E2f1Q61501 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
E2f1Q61501 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
E2f1Q61501 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
E2f1Q61501 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
E2f1Q61501 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
E2f1Q61501 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
E2f1Q61501 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
E2f1Q61501 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
E2f1Q61501 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
E2f1Q61501 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
E2f1Q61501 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
E2f1Q61501 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
E2f1Q61501 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
E2f1Q61501 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
E2f1Q61501 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
E2f1Q61501 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
E2f1Q61501 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms