Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trpc6Q61143 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trpc6Q61143 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trpc6Q61143 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trpc6Q61143 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trpc6Q61143 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Trpc6Q61143 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Trpc6Q61143 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Trpc6Q61143 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trpc6Q61143 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trpc6Q61143 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trpc6Q61143 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trpc6Q61143 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trpc6Q61143 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trpc6Q61143 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trpc6Q61143 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trpc6Q61143 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trpc6Q61143 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trpc6Q61143 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trpc6Q61143 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Trpc6Q61143 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Trpc6Q61143 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trpc6Q61143 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trpc6Q61143 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trpc6Q61143 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trpc6Q61143 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trpc6Q61143 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trpc6Q61143 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trpc6Q61143 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trpc6Q61143 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Trpc6Q61143 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trpc6Q61143 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trpc6Q61143 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Trpc6Q61143 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trpc6Q61143 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trpc6Q61143 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trpc6Q61143 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trpc6Q61143 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trpc6Q61143 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Trpc6Q61143 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Trpc6Q61143 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trpc6Q61143 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Trpc6Q61143 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trpc6Q61143 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trpc6Q61143 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trpc6Q61143 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trpc6Q61143 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trpc6Q61143 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trpc6Q61143 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Trpc6Q61143 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trpc6Q61143 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trpc6Q61143 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trpc6Q61143 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trpc6Q61143 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trpc6Q61143 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trpc6Q61143 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trpc6Q61143 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trpc6Q61143 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trpc6Q61143 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trpc6Q61143 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trpc6Q61143 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trpc6Q61143 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trpc6Q61143 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trpc6Q61143 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trpc6Q61143 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trpc6Q61143 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trpc6Q61143 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Trpc6Q61143 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trpc6Q61143 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trpc6Q61143 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trpc6Q61143 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trpc6Q61143 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trpc6Q61143 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trpc6Q61143 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Trpc6Q61143 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trpc6Q61143 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trpc6Q61143 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trpc6Q61143 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trpc6Q61143 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trpc6Q61143 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trpc6Q61143 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trpc6Q61143 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trpc6Q61143 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Trpc6Q61143 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trpc6Q61143 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trpc6Q61143 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trpc6Q61143 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trpc6Q61143 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trpc6Q61143 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trpc6Q61143 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trpc6Q61143 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Trpc6Q61143 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trpc6Q61143 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trpc6Q61143 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trpc6Q61143 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trpc6Q61143 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trpc6Q61143 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trpc6Q61143 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trpc6Q61143 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trpc6Q61143 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms