Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prpf4bQ61136 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prpf4bQ61136 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Prpf4bQ61136 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prpf4bQ61136 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prpf4bQ61136 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prpf4bQ61136 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Prpf4bQ61136 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Prpf4bQ61136 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Prpf4bQ61136 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Prpf4bQ61136 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Prpf4bQ61136 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Prpf4bQ61136 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Prpf4bQ61136 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Prpf4bQ61136 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Prpf4bQ61136 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Prpf4bQ61136 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Prpf4bQ61136 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Prpf4bQ61136 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Prpf4bQ61136 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Prpf4bQ61136 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Prpf4bQ61136 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Prpf4bQ61136 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Prpf4bQ61136 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Prpf4bQ61136 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Prpf4bQ61136 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Prpf4bQ61136 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Prpf4bQ61136 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Prpf4bQ61136 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Prpf4bQ61136 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Prpf4bQ61136 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Prpf4bQ61136 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Prpf4bQ61136 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Prpf4bQ61136 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Prpf4bQ61136 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Prpf4bQ61136 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Prpf4bQ61136 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Prpf4bQ61136 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Prpf4bQ61136 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Prpf4bQ61136 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Prpf4bQ61136 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Prpf4bQ61136 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Prpf4bQ61136 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Prpf4bQ61136 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Prpf4bQ61136 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Prpf4bQ61136 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Prpf4bQ61136 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Prpf4bQ61136 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Prpf4bQ61136 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Prpf4bQ61136 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Prpf4bQ61136 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Prpf4bQ61136 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Prpf4bQ61136 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Prpf4bQ61136 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Prpf4bQ61136 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prpf4bQ61136 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prpf4bQ61136 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Prpf4bQ61136 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Prpf4bQ61136 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Prpf4bQ61136 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Prpf4bQ61136 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Prpf4bQ61136 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prpf4bQ61136 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prpf4bQ61136 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Prpf4bQ61136 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Prpf4bQ61136 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Prpf4bQ61136 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prpf4bQ61136 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prpf4bQ61136 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prpf4bQ61136 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prpf4bQ61136 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prpf4bQ61136 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prpf4bQ61136 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prpf4bQ61136 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prpf4bQ61136 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Prpf4bQ61136 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Prpf4bQ61136 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Prpf4bQ61136 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Prpf4bQ61136 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prpf4bQ61136 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prpf4bQ61136 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prpf4bQ61136 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prpf4bQ61136 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prpf4bQ61136 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prpf4bQ61136 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Prpf4bQ61136 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Prpf4bQ61136 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Prpf4bQ61136 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Prpf4bQ61136 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prpf4bQ61136 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prpf4bQ61136 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Prpf4bQ61136 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prpf4bQ61136 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prpf4bQ61136 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prpf4bQ61136 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prpf4bQ61136 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Prpf4bQ61136 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prpf4bQ61136 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prpf4bQ61136 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prpf4bQ61136 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
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