Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lamb3Q61087 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lamb3Q61087 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lamb3Q61087 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lamb3Q61087 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lamb3Q61087 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lamb3Q61087 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Lamb3Q61087 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lamb3Q61087 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lamb3Q61087 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lamb3Q61087 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lamb3Q61087 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lamb3Q61087 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lamb3Q61087 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lamb3Q61087 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lamb3Q61087 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lamb3Q61087 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lamb3Q61087 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lamb3Q61087 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lamb3Q61087 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lamb3Q61087 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lamb3Q61087 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lamb3Q61087 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lamb3Q61087 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lamb3Q61087 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lamb3Q61087 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lamb3Q61087 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lamb3Q61087 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lamb3Q61087 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lamb3Q61087 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lamb3Q61087 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lamb3Q61087 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lamb3Q61087 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lamb3Q61087 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lamb3Q61087 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lamb3Q61087 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Lamb3Q61087 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lamb3Q61087 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lamb3Q61087 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lamb3Q61087 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Lamb3Q61087 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lamb3Q61087 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lamb3Q61087 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lamb3Q61087 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lamb3Q61087 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lamb3Q61087 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lamb3Q61087 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lamb3Q61087 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Lamb3Q61087 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Lamb3Q61087 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lamb3Q61087 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lamb3Q61087 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lamb3Q61087 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lamb3Q61087 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lamb3Q61087 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lamb3Q61087 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lamb3Q61087 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Lamb3Q61087 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lamb3Q61087 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lamb3Q61087 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lamb3Q61087 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lamb3Q61087 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Lamb3Q61087 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Lamb3Q61087 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lamb3Q61087 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lamb3Q61087 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lamb3Q61087 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lamb3Q61087 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lamb3Q61087 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lamb3Q61087 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lamb3Q61087 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lamb3Q61087 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lamb3Q61087 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lamb3Q61087 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lamb3Q61087 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lamb3Q61087 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lamb3Q61087 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lamb3Q61087 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lamb3Q61087 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lamb3Q61087 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lamb3Q61087 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lamb3Q61087 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lamb3Q61087 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lamb3Q61087 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lamb3Q61087 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lamb3Q61087 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lamb3Q61087 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lamb3Q61087 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lamb3Q61087 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Lamb3Q61087 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lamb3Q61087 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Lamb3Q61087 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Lamb3Q61087 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lamb3Q61087 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lamb3Q61087 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Lamb3Q61087 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lamb3Q61087 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lamb3Q61087 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lamb3Q61087 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lamb3Q61087 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms