Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1Q61056 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpc1Q61056 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpc1Q61056 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpc1Q61056 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpc1Q61056 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpc1Q61056 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpc1Q61056 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpc1Q61056 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpc1Q61056 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpc1Q61056 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpc1Q61056 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpc1Q61056 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpc1Q61056 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpc1Q61056 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpc1Q61056 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpc1Q61056 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpc1Q61056 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpc1Q61056 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpc1Q61056 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpc1Q61056 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpc1Q61056 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpc1Q61056 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpc1Q61056 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpc1Q61056 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpc1Q61056 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpc1Q61056 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trpc1Q61056 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trpc1Q61056 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpc1Q61056 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpc1Q61056 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpc1Q61056 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpc1Q61056 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpc1Q61056 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpc1Q61056 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpc1Q61056 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpc1Q61056 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpc1Q61056 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpc1Q61056 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpc1Q61056 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpc1Q61056 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpc1Q61056 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpc1Q61056 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpc1Q61056 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpc1Q61056 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpc1Q61056 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpc1Q61056 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpc1Q61056 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpc1Q61056 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpc1Q61056 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpc1Q61056 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpc1Q61056 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpc1Q61056 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpc1Q61056 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpc1Q61056 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpc1Q61056 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpc1Q61056 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpc1Q61056 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpc1Q61056 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpc1Q61056 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpc1Q61056 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpc1Q61056 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpc1Q61056 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpc1Q61056 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpc1Q61056 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpc1Q61056 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trpc1Q61056 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trpc1Q61056 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trpc1Q61056 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpc1Q61056 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpc1Q61056 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpc1Q61056 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpc1Q61056 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpc1Q61056 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpc1Q61056 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpc1Q61056 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpc1Q61056 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpc1Q61056 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpc1Q61056 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpc1Q61056 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpc1Q61056 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpc1Q61056 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpc1Q61056 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpc1Q61056 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpc1Q61056 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpc1Q61056 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpc1Q61056 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpc1Q61056 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpc1Q61056 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpc1Q61056 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trpc1Q61056 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trpc1Q61056 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trpc1Q61056 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trpc1Q61056 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trpc1Q61056 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trpc1Q61056 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trpc1Q61056 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trpc1Q61056 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpc1Q61056 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpc1Q61056 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpc1Q61056 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms