Protein–RNA interactions for Protein: Q60771

Cldn11, Claudin-11, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn11Q60771 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cldn11Q60771 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cldn11Q60771 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cldn11Q60771 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cldn11Q60771 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cldn11Q60771 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cldn11Q60771 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cldn11Q60771 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cldn11Q60771 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cldn11Q60771 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cldn11Q60771 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cldn11Q60771 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cldn11Q60771 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cldn11Q60771 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cldn11Q60771 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cldn11Q60771 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cldn11Q60771 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Cldn11Q60771 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Cldn11Q60771 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cldn11Q60771 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cldn11Q60771 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cldn11Q60771 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cldn11Q60771 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cldn11Q60771 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cldn11Q60771 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cldn11Q60771 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cldn11Q60771 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cldn11Q60771 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cldn11Q60771 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cldn11Q60771 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cldn11Q60771 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cldn11Q60771 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cldn11Q60771 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cldn11Q60771 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cldn11Q60771 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cldn11Q60771 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cldn11Q60771 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Cldn11Q60771 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cldn11Q60771 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cldn11Q60771 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cldn11Q60771 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Cldn11Q60771 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cldn11Q60771 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cldn11Q60771 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cldn11Q60771 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cldn11Q60771 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cldn11Q60771 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cldn11Q60771 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cldn11Q60771 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cldn11Q60771 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cldn11Q60771 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cldn11Q60771 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Cldn11Q60771 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cldn11Q60771 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cldn11Q60771 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cldn11Q60771 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cldn11Q60771 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cldn11Q60771 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cldn11Q60771 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cldn11Q60771 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cldn11Q60771 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cldn11Q60771 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cldn11Q60771 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cldn11Q60771 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cldn11Q60771 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cldn11Q60771 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cldn11Q60771 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cldn11Q60771 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cldn11Q60771 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cldn11Q60771 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cldn11Q60771 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cldn11Q60771 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cldn11Q60771 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cldn11Q60771 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cldn11Q60771 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cldn11Q60771 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cldn11Q60771 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cldn11Q60771 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Cldn11Q60771 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cldn11Q60771 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cldn11Q60771 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cldn11Q60771 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cldn11Q60771 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cldn11Q60771 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cldn11Q60771 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cldn11Q60771 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Cldn11Q60771 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cldn11Q60771 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cldn11Q60771 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cldn11Q60771 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cldn11Q60771 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cldn11Q60771 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cldn11Q60771 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cldn11Q60771 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cldn11Q60771 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cldn11Q60771 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cldn11Q60771 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cldn11Q60771 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cldn11Q60771 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cldn11Q60771 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms