Protein–RNA interactions for Protein: Q60674

Nr1d2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d2Q60674 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr1d2Q60674 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nr1d2Q60674 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nr1d2Q60674 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nr1d2Q60674 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nr1d2Q60674 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nr1d2Q60674 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nr1d2Q60674 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nr1d2Q60674 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nr1d2Q60674 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr1d2Q60674 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr1d2Q60674 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr1d2Q60674 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr1d2Q60674 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nr1d2Q60674 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nr1d2Q60674 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nr1d2Q60674 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nr1d2Q60674 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nr1d2Q60674 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nr1d2Q60674 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nr1d2Q60674 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nr1d2Q60674 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nr1d2Q60674 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nr1d2Q60674 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nr1d2Q60674 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr1d2Q60674 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nr1d2Q60674 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nr1d2Q60674 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nr1d2Q60674 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nr1d2Q60674 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nr1d2Q60674 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nr1d2Q60674 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nr1d2Q60674 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nr1d2Q60674 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nr1d2Q60674 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nr1d2Q60674 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nr1d2Q60674 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nr1d2Q60674 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nr1d2Q60674 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nr1d2Q60674 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nr1d2Q60674 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nr1d2Q60674 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nr1d2Q60674 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nr1d2Q60674 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr1d2Q60674 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr1d2Q60674 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr1d2Q60674 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr1d2Q60674 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr1d2Q60674 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nr1d2Q60674 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nr1d2Q60674 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nr1d2Q60674 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr1d2Q60674 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr1d2Q60674 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nr1d2Q60674 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr1d2Q60674 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr1d2Q60674 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr1d2Q60674 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nr1d2Q60674 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nr1d2Q60674 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr1d2Q60674 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr1d2Q60674 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr1d2Q60674 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr1d2Q60674 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr1d2Q60674 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr1d2Q60674 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr1d2Q60674 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nr1d2Q60674 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nr1d2Q60674 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nr1d2Q60674 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nr1d2Q60674 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nr1d2Q60674 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nr1d2Q60674 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nr1d2Q60674 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nr1d2Q60674 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nr1d2Q60674 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nr1d2Q60674 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nr1d2Q60674 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nr1d2Q60674 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nr1d2Q60674 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nr1d2Q60674 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nr1d2Q60674 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nr1d2Q60674 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nr1d2Q60674 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nr1d2Q60674 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nr1d2Q60674 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Nr1d2Q60674 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nr1d2Q60674 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nr1d2Q60674 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nr1d2Q60674 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nr1d2Q60674 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nr1d2Q60674 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nr1d2Q60674 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nr1d2Q60674 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nr1d2Q60674 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr1d2Q60674 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr1d2Q60674 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr1d2Q60674 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr1d2Q60674 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr1d2Q60674 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms