Protein–RNA interactions for Protein: Q60649

Clpb, Caseinolytic peptidase B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpbQ60649 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ClpbQ60649 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ClpbQ60649 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ClpbQ60649 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ClpbQ60649 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ClpbQ60649 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ClpbQ60649 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ClpbQ60649 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ClpbQ60649 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ClpbQ60649 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ClpbQ60649 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ClpbQ60649 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ClpbQ60649 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ClpbQ60649 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ClpbQ60649 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ClpbQ60649 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ClpbQ60649 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ClpbQ60649 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ClpbQ60649 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ClpbQ60649 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ClpbQ60649 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ClpbQ60649 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ClpbQ60649 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ClpbQ60649 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ClpbQ60649 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ClpbQ60649 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ClpbQ60649 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ClpbQ60649 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ClpbQ60649 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ClpbQ60649 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ClpbQ60649 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ClpbQ60649 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ClpbQ60649 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ClpbQ60649 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ClpbQ60649 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ClpbQ60649 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ClpbQ60649 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ClpbQ60649 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ClpbQ60649 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ClpbQ60649 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ClpbQ60649 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ClpbQ60649 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ClpbQ60649 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ClpbQ60649 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ClpbQ60649 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ClpbQ60649 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ClpbQ60649 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ClpbQ60649 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ClpbQ60649 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ClpbQ60649 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ClpbQ60649 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ClpbQ60649 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ClpbQ60649 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ClpbQ60649 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ClpbQ60649 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ClpbQ60649 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ClpbQ60649 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ClpbQ60649 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ClpbQ60649 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ClpbQ60649 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ClpbQ60649 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ClpbQ60649 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ClpbQ60649 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ClpbQ60649 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ClpbQ60649 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ClpbQ60649 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ClpbQ60649 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ClpbQ60649 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ClpbQ60649 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ClpbQ60649 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ClpbQ60649 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ClpbQ60649 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ClpbQ60649 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ClpbQ60649 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ClpbQ60649 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ClpbQ60649 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ClpbQ60649 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ClpbQ60649 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ClpbQ60649 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ClpbQ60649 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ClpbQ60649 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ClpbQ60649 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ClpbQ60649 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ClpbQ60649 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ClpbQ60649 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ClpbQ60649 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ClpbQ60649 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ClpbQ60649 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ClpbQ60649 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ClpbQ60649 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ClpbQ60649 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ClpbQ60649 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ClpbQ60649 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ClpbQ60649 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ClpbQ60649 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ClpbQ60649 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ClpbQ60649 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ClpbQ60649 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ClpbQ60649 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ClpbQ60649 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms