Protein–RNA interactions for Protein: Q60644

Nr1h2, Oxysterols receptor LXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h2Q60644 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nr1h2Q60644 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nr1h2Q60644 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Nr1h2Q60644 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nr1h2Q60644 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nr1h2Q60644 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nr1h2Q60644 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nr1h2Q60644 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nr1h2Q60644 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nr1h2Q60644 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nr1h2Q60644 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nr1h2Q60644 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nr1h2Q60644 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nr1h2Q60644 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nr1h2Q60644 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nr1h2Q60644 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nr1h2Q60644 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nr1h2Q60644 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nr1h2Q60644 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nr1h2Q60644 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nr1h2Q60644 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nr1h2Q60644 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nr1h2Q60644 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nr1h2Q60644 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nr1h2Q60644 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nr1h2Q60644 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nr1h2Q60644 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nr1h2Q60644 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Nr1h2Q60644 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nr1h2Q60644 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nr1h2Q60644 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nr1h2Q60644 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nr1h2Q60644 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nr1h2Q60644 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nr1h2Q60644 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nr1h2Q60644 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nr1h2Q60644 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nr1h2Q60644 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nr1h2Q60644 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nr1h2Q60644 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nr1h2Q60644 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nr1h2Q60644 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nr1h2Q60644 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nr1h2Q60644 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nr1h2Q60644 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nr1h2Q60644 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nr1h2Q60644 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nr1h2Q60644 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nr1h2Q60644 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nr1h2Q60644 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nr1h2Q60644 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nr1h2Q60644 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nr1h2Q60644 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nr1h2Q60644 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nr1h2Q60644 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nr1h2Q60644 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nr1h2Q60644 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nr1h2Q60644 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nr1h2Q60644 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nr1h2Q60644 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Nr1h2Q60644 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nr1h2Q60644 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nr1h2Q60644 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nr1h2Q60644 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nr1h2Q60644 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nr1h2Q60644 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nr1h2Q60644 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nr1h2Q60644 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nr1h2Q60644 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nr1h2Q60644 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nr1h2Q60644 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nr1h2Q60644 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nr1h2Q60644 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nr1h2Q60644 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nr1h2Q60644 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nr1h2Q60644 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nr1h2Q60644 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nr1h2Q60644 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Nr1h2Q60644 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nr1h2Q60644 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nr1h2Q60644 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nr1h2Q60644 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nr1h2Q60644 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nr1h2Q60644 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nr1h2Q60644 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nr1h2Q60644 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nr1h2Q60644 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nr1h2Q60644 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nr1h2Q60644 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nr1h2Q60644 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nr1h2Q60644 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Nr1h2Q60644 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nr1h2Q60644 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nr1h2Q60644 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nr1h2Q60644 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nr1h2Q60644 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nr1h2Q60644 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nr1h2Q60644 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nr1h2Q60644 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nr1h2Q60644 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms