Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tdrd5Q5VCS6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tdrd5Q5VCS6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tdrd5Q5VCS6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tdrd5Q5VCS6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tdrd5Q5VCS6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tdrd5Q5VCS6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tdrd5Q5VCS6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tdrd5Q5VCS6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tdrd5Q5VCS6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tdrd5Q5VCS6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tdrd5Q5VCS6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tdrd5Q5VCS6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Tdrd5Q5VCS6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tdrd5Q5VCS6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tdrd5Q5VCS6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tdrd5Q5VCS6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tdrd5Q5VCS6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tdrd5Q5VCS6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Tdrd5Q5VCS6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tdrd5Q5VCS6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tdrd5Q5VCS6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tdrd5Q5VCS6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tdrd5Q5VCS6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tdrd5Q5VCS6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tdrd5Q5VCS6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tdrd5Q5VCS6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tdrd5Q5VCS6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tdrd5Q5VCS6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tdrd5Q5VCS6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Tdrd5Q5VCS6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tdrd5Q5VCS6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tdrd5Q5VCS6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tdrd5Q5VCS6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tdrd5Q5VCS6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tdrd5Q5VCS6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tdrd5Q5VCS6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tdrd5Q5VCS6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tdrd5Q5VCS6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tdrd5Q5VCS6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tdrd5Q5VCS6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Tdrd5Q5VCS6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tdrd5Q5VCS6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tdrd5Q5VCS6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tdrd5Q5VCS6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tdrd5Q5VCS6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tdrd5Q5VCS6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tdrd5Q5VCS6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tdrd5Q5VCS6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tdrd5Q5VCS6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tdrd5Q5VCS6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tdrd5Q5VCS6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tdrd5Q5VCS6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tdrd5Q5VCS6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tdrd5Q5VCS6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tdrd5Q5VCS6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tdrd5Q5VCS6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tdrd5Q5VCS6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Tdrd5Q5VCS6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tdrd5Q5VCS6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tdrd5Q5VCS6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tdrd5Q5VCS6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tdrd5Q5VCS6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tdrd5Q5VCS6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tdrd5Q5VCS6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tdrd5Q5VCS6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tdrd5Q5VCS6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tdrd5Q5VCS6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tdrd5Q5VCS6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tdrd5Q5VCS6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Tdrd5Q5VCS6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tdrd5Q5VCS6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tdrd5Q5VCS6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tdrd5Q5VCS6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tdrd5Q5VCS6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tdrd5Q5VCS6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tdrd5Q5VCS6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tdrd5Q5VCS6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tdrd5Q5VCS6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tdrd5Q5VCS6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tdrd5Q5VCS6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tdrd5Q5VCS6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tdrd5Q5VCS6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tdrd5Q5VCS6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Tdrd5Q5VCS6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tdrd5Q5VCS6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tdrd5Q5VCS6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tdrd5Q5VCS6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tdrd5Q5VCS6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Tdrd5Q5VCS6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tdrd5Q5VCS6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tdrd5Q5VCS6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Tdrd5Q5VCS6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tdrd5Q5VCS6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tdrd5Q5VCS6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tdrd5Q5VCS6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tdrd5Q5VCS6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tdrd5Q5VCS6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tdrd5Q5VCS6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tdrd5Q5VCS6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms