Protein–RNA interactions for Protein: Q5U406

Zfp78, Zinc finger protein 78, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp78Q5U406 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zfp78Q5U406 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zfp78Q5U406 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Zfp78Q5U406 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Zfp78Q5U406 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zfp78Q5U406 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zfp78Q5U406 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zfp78Q5U406 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zfp78Q5U406 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zfp78Q5U406 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zfp78Q5U406 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zfp78Q5U406 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zfp78Q5U406 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfp78Q5U406 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfp78Q5U406 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfp78Q5U406 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfp78Q5U406 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfp78Q5U406 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfp78Q5U406 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfp78Q5U406 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfp78Q5U406 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zfp78Q5U406 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zfp78Q5U406 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zfp78Q5U406 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zfp78Q5U406 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zfp78Q5U406 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zfp78Q5U406 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Zfp78Q5U406 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zfp78Q5U406 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zfp78Q5U406 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zfp78Q5U406 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zfp78Q5U406 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zfp78Q5U406 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Zfp78Q5U406 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zfp78Q5U406 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zfp78Q5U406 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zfp78Q5U406 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Zfp78Q5U406 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zfp78Q5U406 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zfp78Q5U406 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zfp78Q5U406 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zfp78Q5U406 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zfp78Q5U406 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zfp78Q5U406 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zfp78Q5U406 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zfp78Q5U406 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zfp78Q5U406 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zfp78Q5U406 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zfp78Q5U406 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zfp78Q5U406 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zfp78Q5U406 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zfp78Q5U406 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zfp78Q5U406 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfp78Q5U406 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfp78Q5U406 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfp78Q5U406 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfp78Q5U406 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfp78Q5U406 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zfp78Q5U406 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zfp78Q5U406 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zfp78Q5U406 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zfp78Q5U406 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zfp78Q5U406 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Zfp78Q5U406 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zfp78Q5U406 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zfp78Q5U406 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfp78Q5U406 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfp78Q5U406 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfp78Q5U406 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfp78Q5U406 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfp78Q5U406 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfp78Q5U406 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfp78Q5U406 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfp78Q5U406 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfp78Q5U406 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Zfp78Q5U406 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfp78Q5U406 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfp78Q5U406 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfp78Q5U406 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfp78Q5U406 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfp78Q5U406 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfp78Q5U406 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zfp78Q5U406 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zfp78Q5U406 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfp78Q5U406 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfp78Q5U406 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfp78Q5U406 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfp78Q5U406 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfp78Q5U406 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfp78Q5U406 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfp78Q5U406 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfp78Q5U406 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfp78Q5U406 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfp78Q5U406 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfp78Q5U406 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfp78Q5U406 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp78Q5U406 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp78Q5U406 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp78Q5U406 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp78Q5U406 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms