Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWK7

Rnf145, RING finger protein 145, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf145Q5SWK7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf145Q5SWK7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf145Q5SWK7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf145Q5SWK7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf145Q5SWK7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf145Q5SWK7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rnf145Q5SWK7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf145Q5SWK7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf145Q5SWK7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf145Q5SWK7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf145Q5SWK7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf145Q5SWK7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf145Q5SWK7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf145Q5SWK7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rnf145Q5SWK7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf145Q5SWK7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf145Q5SWK7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf145Q5SWK7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf145Q5SWK7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf145Q5SWK7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf145Q5SWK7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf145Q5SWK7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf145Q5SWK7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf145Q5SWK7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf145Q5SWK7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf145Q5SWK7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf145Q5SWK7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf145Q5SWK7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rnf145Q5SWK7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rnf145Q5SWK7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rnf145Q5SWK7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rnf145Q5SWK7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf145Q5SWK7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf145Q5SWK7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf145Q5SWK7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf145Q5SWK7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf145Q5SWK7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf145Q5SWK7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf145Q5SWK7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf145Q5SWK7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf145Q5SWK7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf145Q5SWK7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf145Q5SWK7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf145Q5SWK7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf145Q5SWK7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf145Q5SWK7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf145Q5SWK7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf145Q5SWK7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf145Q5SWK7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf145Q5SWK7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rnf145Q5SWK7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rnf145Q5SWK7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnf145Q5SWK7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnf145Q5SWK7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf145Q5SWK7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf145Q5SWK7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf145Q5SWK7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf145Q5SWK7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf145Q5SWK7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf145Q5SWK7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf145Q5SWK7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf145Q5SWK7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf145Q5SWK7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf145Q5SWK7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf145Q5SWK7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf145Q5SWK7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf145Q5SWK7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf145Q5SWK7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf145Q5SWK7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rnf145Q5SWK7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf145Q5SWK7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf145Q5SWK7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf145Q5SWK7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf145Q5SWK7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf145Q5SWK7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnf145Q5SWK7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnf145Q5SWK7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rnf145Q5SWK7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rnf145Q5SWK7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rnf145Q5SWK7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rnf145Q5SWK7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rnf145Q5SWK7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Rnf145Q5SWK7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rnf145Q5SWK7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rnf145Q5SWK7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rnf145Q5SWK7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf145Q5SWK7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf145Q5SWK7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf145Q5SWK7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf145Q5SWK7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnf145Q5SWK7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnf145Q5SWK7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnf145Q5SWK7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnf145Q5SWK7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnf145Q5SWK7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnf145Q5SWK7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rnf145Q5SWK7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rnf145Q5SWK7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf145Q5SWK7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf145Q5SWK7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms