Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSA0

Vmn1r223, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r223Q5SSA0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r223Q5SSA0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Vmn1r223Q5SSA0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r223Q5SSA0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r223Q5SSA0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r223Q5SSA0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r223Q5SSA0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r223Q5SSA0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r223Q5SSA0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r223Q5SSA0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r223Q5SSA0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r223Q5SSA0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r223Q5SSA0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r223Q5SSA0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Vmn1r223Q5SSA0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r223Q5SSA0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r223Q5SSA0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r223Q5SSA0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r223Q5SSA0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r223Q5SSA0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vmn1r223Q5SSA0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vmn1r223Q5SSA0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r223Q5SSA0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r223Q5SSA0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r223Q5SSA0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r223Q5SSA0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r223Q5SSA0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r223Q5SSA0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r223Q5SSA0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r223Q5SSA0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r223Q5SSA0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r223Q5SSA0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r223Q5SSA0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r223Q5SSA0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r223Q5SSA0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r223Q5SSA0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r223Q5SSA0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r223Q5SSA0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r223Q5SSA0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn1r223Q5SSA0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn1r223Q5SSA0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn1r223Q5SSA0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn1r223Q5SSA0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn1r223Q5SSA0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vmn1r223Q5SSA0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn1r223Q5SSA0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r223Q5SSA0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r223Q5SSA0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r223Q5SSA0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r223Q5SSA0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r223Q5SSA0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r223Q5SSA0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r223Q5SSA0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r223Q5SSA0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r223Q5SSA0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn1r223Q5SSA0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn1r223Q5SSA0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn1r223Q5SSA0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r223Q5SSA0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r223Q5SSA0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r223Q5SSA0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r223Q5SSA0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r223Q5SSA0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r223Q5SSA0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r223Q5SSA0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r223Q5SSA0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r223Q5SSA0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r223Q5SSA0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r223Q5SSA0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r223Q5SSA0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r223Q5SSA0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r223Q5SSA0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r223Q5SSA0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r223Q5SSA0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r223Q5SSA0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r223Q5SSA0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r223Q5SSA0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r223Q5SSA0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r223Q5SSA0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r223Q5SSA0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r223Q5SSA0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r223Q5SSA0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r223Q5SSA0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r223Q5SSA0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r223Q5SSA0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r223Q5SSA0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r223Q5SSA0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r223Q5SSA0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r223Q5SSA0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r223Q5SSA0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r223Q5SSA0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r223Q5SSA0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r223Q5SSA0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r223Q5SSA0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r223Q5SSA0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r223Q5SSA0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r223Q5SSA0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms