Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP45

5730522E02Rik, RIKEN cDNA 5730522E02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730522E02RikQ5SP45 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
5730522E02RikQ5SP45 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
5730522E02RikQ5SP45 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
5730522E02RikQ5SP45 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
5730522E02RikQ5SP45 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
5730522E02RikQ5SP45 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
5730522E02RikQ5SP45 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
5730522E02RikQ5SP45 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
5730522E02RikQ5SP45 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
5730522E02RikQ5SP45 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
5730522E02RikQ5SP45 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
5730522E02RikQ5SP45 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
5730522E02RikQ5SP45 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
5730522E02RikQ5SP45 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
5730522E02RikQ5SP45 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
5730522E02RikQ5SP45 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
5730522E02RikQ5SP45 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
5730522E02RikQ5SP45 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
5730522E02RikQ5SP45 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
5730522E02RikQ5SP45 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
5730522E02RikQ5SP45 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
5730522E02RikQ5SP45 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
5730522E02RikQ5SP45 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
5730522E02RikQ5SP45 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
5730522E02RikQ5SP45 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
5730522E02RikQ5SP45 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
5730522E02RikQ5SP45 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
5730522E02RikQ5SP45 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
5730522E02RikQ5SP45 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
5730522E02RikQ5SP45 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
5730522E02RikQ5SP45 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
5730522E02RikQ5SP45 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
5730522E02RikQ5SP45 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
5730522E02RikQ5SP45 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
5730522E02RikQ5SP45 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
5730522E02RikQ5SP45 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
5730522E02RikQ5SP45 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
5730522E02RikQ5SP45 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
5730522E02RikQ5SP45 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
5730522E02RikQ5SP45 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
5730522E02RikQ5SP45 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
5730522E02RikQ5SP45 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
5730522E02RikQ5SP45 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
5730522E02RikQ5SP45 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
5730522E02RikQ5SP45 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
5730522E02RikQ5SP45 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
5730522E02RikQ5SP45 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
5730522E02RikQ5SP45 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
5730522E02RikQ5SP45 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
5730522E02RikQ5SP45 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
5730522E02RikQ5SP45 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
5730522E02RikQ5SP45 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
5730522E02RikQ5SP45 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
5730522E02RikQ5SP45 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
5730522E02RikQ5SP45 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
5730522E02RikQ5SP45 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
5730522E02RikQ5SP45 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
5730522E02RikQ5SP45 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
5730522E02RikQ5SP45 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
5730522E02RikQ5SP45 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
5730522E02RikQ5SP45 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
5730522E02RikQ5SP45 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
5730522E02RikQ5SP45 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
5730522E02RikQ5SP45 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
5730522E02RikQ5SP45 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
5730522E02RikQ5SP45 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
5730522E02RikQ5SP45 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
5730522E02RikQ5SP45 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
5730522E02RikQ5SP45 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
5730522E02RikQ5SP45 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
5730522E02RikQ5SP45 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
5730522E02RikQ5SP45 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
5730522E02RikQ5SP45 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
5730522E02RikQ5SP45 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
5730522E02RikQ5SP45 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
5730522E02RikQ5SP45 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
5730522E02RikQ5SP45 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
5730522E02RikQ5SP45 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
5730522E02RikQ5SP45 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
5730522E02RikQ5SP45 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
5730522E02RikQ5SP45 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
5730522E02RikQ5SP45 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
5730522E02RikQ5SP45 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
5730522E02RikQ5SP45 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
5730522E02RikQ5SP45 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
5730522E02RikQ5SP45 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
5730522E02RikQ5SP45 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
5730522E02RikQ5SP45 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
5730522E02RikQ5SP45 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
5730522E02RikQ5SP45 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
5730522E02RikQ5SP45 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
5730522E02RikQ5SP45 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
5730522E02RikQ5SP45 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
5730522E02RikQ5SP45 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
5730522E02RikQ5SP45 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
5730522E02RikQ5SP45 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
5730522E02RikQ5SP45 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
5730522E02RikQ5SP45 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
5730522E02RikQ5SP45 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
5730522E02RikQ5SP45 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms