Protein–RNA interactions for Protein: Q5M6W3

Clhc1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clhc1Q5M6W3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clhc1Q5M6W3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Clhc1Q5M6W3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clhc1Q5M6W3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clhc1Q5M6W3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Clhc1Q5M6W3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clhc1Q5M6W3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clhc1Q5M6W3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clhc1Q5M6W3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clhc1Q5M6W3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clhc1Q5M6W3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clhc1Q5M6W3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clhc1Q5M6W3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clhc1Q5M6W3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clhc1Q5M6W3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clhc1Q5M6W3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Clhc1Q5M6W3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clhc1Q5M6W3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clhc1Q5M6W3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clhc1Q5M6W3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clhc1Q5M6W3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clhc1Q5M6W3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clhc1Q5M6W3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clhc1Q5M6W3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clhc1Q5M6W3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clhc1Q5M6W3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clhc1Q5M6W3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clhc1Q5M6W3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clhc1Q5M6W3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clhc1Q5M6W3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clhc1Q5M6W3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clhc1Q5M6W3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clhc1Q5M6W3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clhc1Q5M6W3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clhc1Q5M6W3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clhc1Q5M6W3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clhc1Q5M6W3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clhc1Q5M6W3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clhc1Q5M6W3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Clhc1Q5M6W3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clhc1Q5M6W3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clhc1Q5M6W3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clhc1Q5M6W3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clhc1Q5M6W3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Clhc1Q5M6W3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clhc1Q5M6W3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clhc1Q5M6W3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clhc1Q5M6W3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Clhc1Q5M6W3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clhc1Q5M6W3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clhc1Q5M6W3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clhc1Q5M6W3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clhc1Q5M6W3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clhc1Q5M6W3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Clhc1Q5M6W3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clhc1Q5M6W3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clhc1Q5M6W3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clhc1Q5M6W3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clhc1Q5M6W3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clhc1Q5M6W3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clhc1Q5M6W3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clhc1Q5M6W3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clhc1Q5M6W3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clhc1Q5M6W3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clhc1Q5M6W3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clhc1Q5M6W3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clhc1Q5M6W3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clhc1Q5M6W3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clhc1Q5M6W3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clhc1Q5M6W3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clhc1Q5M6W3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clhc1Q5M6W3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clhc1Q5M6W3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clhc1Q5M6W3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clhc1Q5M6W3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clhc1Q5M6W3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clhc1Q5M6W3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clhc1Q5M6W3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clhc1Q5M6W3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clhc1Q5M6W3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clhc1Q5M6W3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clhc1Q5M6W3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clhc1Q5M6W3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clhc1Q5M6W3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clhc1Q5M6W3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clhc1Q5M6W3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clhc1Q5M6W3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clhc1Q5M6W3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clhc1Q5M6W3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clhc1Q5M6W3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clhc1Q5M6W3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clhc1Q5M6W3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clhc1Q5M6W3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clhc1Q5M6W3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clhc1Q5M6W3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clhc1Q5M6W3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clhc1Q5M6W3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clhc1Q5M6W3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clhc1Q5M6W3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clhc1Q5M6W3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms