Protein–RNA interactions for Protein: Q5IRJ6

Slc30a9, Zinc transporter 9, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc30a9Q5IRJ6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc30a9Q5IRJ6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Slc30a9Q5IRJ6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc30a9Q5IRJ6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc30a9Q5IRJ6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc30a9Q5IRJ6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc30a9Q5IRJ6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc30a9Q5IRJ6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc30a9Q5IRJ6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc30a9Q5IRJ6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc30a9Q5IRJ6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc30a9Q5IRJ6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc30a9Q5IRJ6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc30a9Q5IRJ6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc30a9Q5IRJ6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc30a9Q5IRJ6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc30a9Q5IRJ6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc30a9Q5IRJ6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc30a9Q5IRJ6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc30a9Q5IRJ6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc30a9Q5IRJ6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc30a9Q5IRJ6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc30a9Q5IRJ6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc30a9Q5IRJ6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc30a9Q5IRJ6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc30a9Q5IRJ6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc30a9Q5IRJ6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc30a9Q5IRJ6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc30a9Q5IRJ6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc30a9Q5IRJ6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc30a9Q5IRJ6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc30a9Q5IRJ6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc30a9Q5IRJ6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc30a9Q5IRJ6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc30a9Q5IRJ6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc30a9Q5IRJ6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc30a9Q5IRJ6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc30a9Q5IRJ6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc30a9Q5IRJ6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc30a9Q5IRJ6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc30a9Q5IRJ6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc30a9Q5IRJ6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc30a9Q5IRJ6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc30a9Q5IRJ6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc30a9Q5IRJ6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc30a9Q5IRJ6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc30a9Q5IRJ6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc30a9Q5IRJ6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc30a9Q5IRJ6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc30a9Q5IRJ6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc30a9Q5IRJ6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc30a9Q5IRJ6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc30a9Q5IRJ6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc30a9Q5IRJ6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc30a9Q5IRJ6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc30a9Q5IRJ6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc30a9Q5IRJ6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc30a9Q5IRJ6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc30a9Q5IRJ6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc30a9Q5IRJ6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc30a9Q5IRJ6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc30a9Q5IRJ6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc30a9Q5IRJ6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc30a9Q5IRJ6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc30a9Q5IRJ6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc30a9Q5IRJ6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc30a9Q5IRJ6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc30a9Q5IRJ6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc30a9Q5IRJ6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc30a9Q5IRJ6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc30a9Q5IRJ6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc30a9Q5IRJ6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc30a9Q5IRJ6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc30a9Q5IRJ6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc30a9Q5IRJ6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc30a9Q5IRJ6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc30a9Q5IRJ6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc30a9Q5IRJ6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc30a9Q5IRJ6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc30a9Q5IRJ6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc30a9Q5IRJ6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc30a9Q5IRJ6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc30a9Q5IRJ6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc30a9Q5IRJ6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc30a9Q5IRJ6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc30a9Q5IRJ6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Slc30a9Q5IRJ6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc30a9Q5IRJ6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc30a9Q5IRJ6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc30a9Q5IRJ6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc30a9Q5IRJ6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc30a9Q5IRJ6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc30a9Q5IRJ6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc30a9Q5IRJ6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc30a9Q5IRJ6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc30a9Q5IRJ6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc30a9Q5IRJ6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc30a9Q5IRJ6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc30a9Q5IRJ6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc30a9Q5IRJ6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms