Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU28

Pcnx2, Pecanex-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcnx2Q5DU28 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcnx2Q5DU28 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcnx2Q5DU28 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcnx2Q5DU28 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcnx2Q5DU28 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcnx2Q5DU28 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcnx2Q5DU28 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
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Pcnx2Q5DU28 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcnx2Q5DU28 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
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Pcnx2Q5DU28 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcnx2Q5DU28 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcnx2Q5DU28 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcnx2Q5DU28 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
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Pcnx2Q5DU28 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
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Pcnx2Q5DU28 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcnx2Q5DU28 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcnx2Q5DU28 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcnx2Q5DU28 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
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Pcnx2Q5DU28 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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Pcnx2Q5DU28 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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Pcnx2Q5DU28 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Pcnx2Q5DU28 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms