Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTU0

Afap1l2, Actin filament-associated protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afap1l2Q5DTU0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Afap1l2Q5DTU0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Afap1l2Q5DTU0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Afap1l2Q5DTU0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Afap1l2Q5DTU0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Afap1l2Q5DTU0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Afap1l2Q5DTU0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Afap1l2Q5DTU0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Afap1l2Q5DTU0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Afap1l2Q5DTU0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Afap1l2Q5DTU0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Afap1l2Q5DTU0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Afap1l2Q5DTU0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Afap1l2Q5DTU0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Afap1l2Q5DTU0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Afap1l2Q5DTU0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Afap1l2Q5DTU0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Afap1l2Q5DTU0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Afap1l2Q5DTU0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Afap1l2Q5DTU0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Afap1l2Q5DTU0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Afap1l2Q5DTU0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Afap1l2Q5DTU0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Afap1l2Q5DTU0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Afap1l2Q5DTU0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Afap1l2Q5DTU0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Afap1l2Q5DTU0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Afap1l2Q5DTU0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Afap1l2Q5DTU0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Afap1l2Q5DTU0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Afap1l2Q5DTU0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Afap1l2Q5DTU0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Afap1l2Q5DTU0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Afap1l2Q5DTU0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Afap1l2Q5DTU0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Afap1l2Q5DTU0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Afap1l2Q5DTU0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Afap1l2Q5DTU0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Afap1l2Q5DTU0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Afap1l2Q5DTU0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Afap1l2Q5DTU0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Afap1l2Q5DTU0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Afap1l2Q5DTU0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Afap1l2Q5DTU0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Afap1l2Q5DTU0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Afap1l2Q5DTU0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Afap1l2Q5DTU0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Afap1l2Q5DTU0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Afap1l2Q5DTU0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Afap1l2Q5DTU0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Afap1l2Q5DTU0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Afap1l2Q5DTU0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Afap1l2Q5DTU0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Afap1l2Q5DTU0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Afap1l2Q5DTU0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Afap1l2Q5DTU0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Afap1l2Q5DTU0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Afap1l2Q5DTU0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Afap1l2Q5DTU0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Afap1l2Q5DTU0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Afap1l2Q5DTU0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Afap1l2Q5DTU0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Afap1l2Q5DTU0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Afap1l2Q5DTU0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Afap1l2Q5DTU0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Afap1l2Q5DTU0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Afap1l2Q5DTU0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Afap1l2Q5DTU0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Afap1l2Q5DTU0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Afap1l2Q5DTU0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Afap1l2Q5DTU0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Afap1l2Q5DTU0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Afap1l2Q5DTU0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Afap1l2Q5DTU0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Afap1l2Q5DTU0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Afap1l2Q5DTU0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Afap1l2Q5DTU0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Afap1l2Q5DTU0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Afap1l2Q5DTU0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Afap1l2Q5DTU0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Afap1l2Q5DTU0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Afap1l2Q5DTU0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Afap1l2Q5DTU0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Afap1l2Q5DTU0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Afap1l2Q5DTU0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Afap1l2Q5DTU0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Afap1l2Q5DTU0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Afap1l2Q5DTU0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Afap1l2Q5DTU0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Afap1l2Q5DTU0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Afap1l2Q5DTU0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Afap1l2Q5DTU0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Afap1l2Q5DTU0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Afap1l2Q5DTU0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Afap1l2Q5DTU0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Afap1l2Q5DTU0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Afap1l2Q5DTU0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Afap1l2Q5DTU0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Afap1l2Q5DTU0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Afap1l2Q5DTU0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms