Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chsy3Q5DTK1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chsy3Q5DTK1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chsy3Q5DTK1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chsy3Q5DTK1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chsy3Q5DTK1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chsy3Q5DTK1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chsy3Q5DTK1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chsy3Q5DTK1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chsy3Q5DTK1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chsy3Q5DTK1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chsy3Q5DTK1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chsy3Q5DTK1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chsy3Q5DTK1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chsy3Q5DTK1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chsy3Q5DTK1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chsy3Q5DTK1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Chsy3Q5DTK1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chsy3Q5DTK1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chsy3Q5DTK1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Chsy3Q5DTK1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chsy3Q5DTK1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chsy3Q5DTK1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Chsy3Q5DTK1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chsy3Q5DTK1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chsy3Q5DTK1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chsy3Q5DTK1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chsy3Q5DTK1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chsy3Q5DTK1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chsy3Q5DTK1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Chsy3Q5DTK1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chsy3Q5DTK1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chsy3Q5DTK1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chsy3Q5DTK1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chsy3Q5DTK1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chsy3Q5DTK1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chsy3Q5DTK1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chsy3Q5DTK1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chsy3Q5DTK1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Chsy3Q5DTK1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chsy3Q5DTK1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chsy3Q5DTK1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chsy3Q5DTK1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chsy3Q5DTK1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chsy3Q5DTK1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chsy3Q5DTK1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chsy3Q5DTK1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chsy3Q5DTK1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Chsy3Q5DTK1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chsy3Q5DTK1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chsy3Q5DTK1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chsy3Q5DTK1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chsy3Q5DTK1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chsy3Q5DTK1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chsy3Q5DTK1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chsy3Q5DTK1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chsy3Q5DTK1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Chsy3Q5DTK1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chsy3Q5DTK1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chsy3Q5DTK1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chsy3Q5DTK1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chsy3Q5DTK1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chsy3Q5DTK1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chsy3Q5DTK1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chsy3Q5DTK1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chsy3Q5DTK1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chsy3Q5DTK1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Chsy3Q5DTK1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chsy3Q5DTK1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chsy3Q5DTK1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chsy3Q5DTK1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chsy3Q5DTK1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chsy3Q5DTK1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chsy3Q5DTK1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chsy3Q5DTK1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chsy3Q5DTK1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chsy3Q5DTK1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chsy3Q5DTK1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chsy3Q5DTK1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chsy3Q5DTK1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chsy3Q5DTK1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chsy3Q5DTK1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chsy3Q5DTK1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chsy3Q5DTK1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chsy3Q5DTK1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chsy3Q5DTK1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chsy3Q5DTK1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chsy3Q5DTK1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Chsy3Q5DTK1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chsy3Q5DTK1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chsy3Q5DTK1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chsy3Q5DTK1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chsy3Q5DTK1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chsy3Q5DTK1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chsy3Q5DTK1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chsy3Q5DTK1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chsy3Q5DTK1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chsy3Q5DTK1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chsy3Q5DTK1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chsy3Q5DTK1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms