Protein–RNA interactions for Protein: Q5BL07

Pex1, Peroxisome biogenesis factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex1Q5BL07 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pex1Q5BL07 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pex1Q5BL07 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pex1Q5BL07 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Pex1Q5BL07 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pex1Q5BL07 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pex1Q5BL07 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pex1Q5BL07 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Pex1Q5BL07 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pex1Q5BL07 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pex1Q5BL07 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pex1Q5BL07 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pex1Q5BL07 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pex1Q5BL07 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pex1Q5BL07 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pex1Q5BL07 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pex1Q5BL07 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pex1Q5BL07 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pex1Q5BL07 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Pex1Q5BL07 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Pex1Q5BL07 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pex1Q5BL07 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pex1Q5BL07 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pex1Q5BL07 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pex1Q5BL07 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Pex1Q5BL07 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pex1Q5BL07 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pex1Q5BL07 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Pex1Q5BL07 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Pex1Q5BL07 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pex1Q5BL07 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pex1Q5BL07 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pex1Q5BL07 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pex1Q5BL07 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pex1Q5BL07 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pex1Q5BL07 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pex1Q5BL07 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pex1Q5BL07 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pex1Q5BL07 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pex1Q5BL07 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pex1Q5BL07 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pex1Q5BL07 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pex1Q5BL07 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pex1Q5BL07 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pex1Q5BL07 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pex1Q5BL07 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pex1Q5BL07 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pex1Q5BL07 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Pex1Q5BL07 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pex1Q5BL07 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pex1Q5BL07 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pex1Q5BL07 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pex1Q5BL07 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pex1Q5BL07 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pex1Q5BL07 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pex1Q5BL07 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pex1Q5BL07 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pex1Q5BL07 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pex1Q5BL07 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pex1Q5BL07 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pex1Q5BL07 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pex1Q5BL07 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pex1Q5BL07 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pex1Q5BL07 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pex1Q5BL07 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Pex1Q5BL07 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Pex1Q5BL07 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pex1Q5BL07 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pex1Q5BL07 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pex1Q5BL07 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pex1Q5BL07 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pex1Q5BL07 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pex1Q5BL07 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pex1Q5BL07 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Pex1Q5BL07 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pex1Q5BL07 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pex1Q5BL07 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pex1Q5BL07 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Pex1Q5BL07 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pex1Q5BL07 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pex1Q5BL07 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pex1Q5BL07 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pex1Q5BL07 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pex1Q5BL07 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pex1Q5BL07 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Pex1Q5BL07 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pex1Q5BL07 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pex1Q5BL07 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pex1Q5BL07 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pex1Q5BL07 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pex1Q5BL07 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pex1Q5BL07 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pex1Q5BL07 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pex1Q5BL07 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Pex1Q5BL07 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pex1Q5BL07 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pex1Q5BL07 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pex1Q5BL07 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pex1Q5BL07 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pex1Q5BL07 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms