Protein–RNA interactions for Protein: Q56A07

Scn2b, Sodium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2bQ56A07 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Scn2bQ56A07 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scn2bQ56A07 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scn2bQ56A07 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scn2bQ56A07 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scn2bQ56A07 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scn2bQ56A07 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scn2bQ56A07 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scn2bQ56A07 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Scn2bQ56A07 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scn2bQ56A07 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scn2bQ56A07 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Scn2bQ56A07 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Scn2bQ56A07 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scn2bQ56A07 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scn2bQ56A07 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Scn2bQ56A07 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Scn2bQ56A07 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Scn2bQ56A07 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scn2bQ56A07 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scn2bQ56A07 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Scn2bQ56A07 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scn2bQ56A07 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scn2bQ56A07 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scn2bQ56A07 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scn2bQ56A07 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scn2bQ56A07 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scn2bQ56A07 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scn2bQ56A07 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scn2bQ56A07 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scn2bQ56A07 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scn2bQ56A07 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scn2bQ56A07 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scn2bQ56A07 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scn2bQ56A07 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scn2bQ56A07 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scn2bQ56A07 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scn2bQ56A07 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scn2bQ56A07 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scn2bQ56A07 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scn2bQ56A07 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scn2bQ56A07 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scn2bQ56A07 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scn2bQ56A07 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scn2bQ56A07 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scn2bQ56A07 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Scn2bQ56A07 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scn2bQ56A07 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scn2bQ56A07 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scn2bQ56A07 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scn2bQ56A07 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scn2bQ56A07 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scn2bQ56A07 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scn2bQ56A07 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scn2bQ56A07 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scn2bQ56A07 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scn2bQ56A07 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scn2bQ56A07 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scn2bQ56A07 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scn2bQ56A07 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scn2bQ56A07 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scn2bQ56A07 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scn2bQ56A07 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scn2bQ56A07 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scn2bQ56A07 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scn2bQ56A07 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scn2bQ56A07 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scn2bQ56A07 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scn2bQ56A07 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scn2bQ56A07 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scn2bQ56A07 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scn2bQ56A07 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scn2bQ56A07 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Scn2bQ56A07 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scn2bQ56A07 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scn2bQ56A07 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Scn2bQ56A07 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scn2bQ56A07 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scn2bQ56A07 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scn2bQ56A07 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scn2bQ56A07 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scn2bQ56A07 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scn2bQ56A07 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Scn2bQ56A07 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scn2bQ56A07 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scn2bQ56A07 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scn2bQ56A07 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scn2bQ56A07 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scn2bQ56A07 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scn2bQ56A07 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scn2bQ56A07 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scn2bQ56A07 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scn2bQ56A07 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scn2bQ56A07 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scn2bQ56A07 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scn2bQ56A07 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scn2bQ56A07 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scn2bQ56A07 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scn2bQ56A07 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scn2bQ56A07 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms