Protein–RNA interactions for Protein: Q505D7

Opa3, Optic atrophy 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa3Q505D7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Opa3Q505D7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Opa3Q505D7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Opa3Q505D7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Opa3Q505D7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Opa3Q505D7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Opa3Q505D7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Opa3Q505D7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Opa3Q505D7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Opa3Q505D7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Opa3Q505D7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Opa3Q505D7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Opa3Q505D7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Opa3Q505D7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Opa3Q505D7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Opa3Q505D7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Opa3Q505D7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Opa3Q505D7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Opa3Q505D7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Opa3Q505D7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Opa3Q505D7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Opa3Q505D7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Opa3Q505D7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Opa3Q505D7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Opa3Q505D7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Opa3Q505D7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Opa3Q505D7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Opa3Q505D7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Opa3Q505D7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Opa3Q505D7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Opa3Q505D7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Opa3Q505D7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Opa3Q505D7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Opa3Q505D7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Opa3Q505D7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Opa3Q505D7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Opa3Q505D7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Opa3Q505D7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Opa3Q505D7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Opa3Q505D7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Opa3Q505D7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Opa3Q505D7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Opa3Q505D7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Opa3Q505D7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Opa3Q505D7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Opa3Q505D7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Opa3Q505D7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Opa3Q505D7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Opa3Q505D7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Opa3Q505D7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Opa3Q505D7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Opa3Q505D7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Opa3Q505D7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Opa3Q505D7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Opa3Q505D7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Opa3Q505D7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Opa3Q505D7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Opa3Q505D7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Opa3Q505D7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Opa3Q505D7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Opa3Q505D7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Opa3Q505D7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Opa3Q505D7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Opa3Q505D7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Opa3Q505D7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Opa3Q505D7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Opa3Q505D7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Opa3Q505D7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Opa3Q505D7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Opa3Q505D7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Opa3Q505D7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Opa3Q505D7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Opa3Q505D7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Opa3Q505D7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Opa3Q505D7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Opa3Q505D7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Opa3Q505D7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Opa3Q505D7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Opa3Q505D7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Opa3Q505D7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Opa3Q505D7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Opa3Q505D7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Opa3Q505D7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Opa3Q505D7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Opa3Q505D7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Opa3Q505D7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Opa3Q505D7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Opa3Q505D7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Opa3Q505D7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Opa3Q505D7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Opa3Q505D7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Opa3Q505D7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Opa3Q505D7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Opa3Q505D7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Opa3Q505D7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Opa3Q505D7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Opa3Q505D7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Opa3Q505D7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Opa3Q505D7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Opa3Q505D7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms