Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZGD8

Nxf2, Nuclear RNA export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxf2Q4ZGD8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nxf2Q4ZGD8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Nxf2Q4ZGD8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nxf2Q4ZGD8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nxf2Q4ZGD8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nxf2Q4ZGD8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nxf2Q4ZGD8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nxf2Q4ZGD8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nxf2Q4ZGD8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nxf2Q4ZGD8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nxf2Q4ZGD8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Nxf2Q4ZGD8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nxf2Q4ZGD8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nxf2Q4ZGD8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nxf2Q4ZGD8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nxf2Q4ZGD8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nxf2Q4ZGD8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nxf2Q4ZGD8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Nxf2Q4ZGD8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nxf2Q4ZGD8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nxf2Q4ZGD8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nxf2Q4ZGD8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nxf2Q4ZGD8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nxf2Q4ZGD8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nxf2Q4ZGD8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nxf2Q4ZGD8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nxf2Q4ZGD8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nxf2Q4ZGD8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Nxf2Q4ZGD8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nxf2Q4ZGD8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Nxf2Q4ZGD8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nxf2Q4ZGD8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Nxf2Q4ZGD8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nxf2Q4ZGD8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nxf2Q4ZGD8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Nxf2Q4ZGD8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nxf2Q4ZGD8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nxf2Q4ZGD8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nxf2Q4ZGD8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nxf2Q4ZGD8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nxf2Q4ZGD8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nxf2Q4ZGD8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Nxf2Q4ZGD8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nxf2Q4ZGD8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nxf2Q4ZGD8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nxf2Q4ZGD8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nxf2Q4ZGD8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nxf2Q4ZGD8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Nxf2Q4ZGD8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nxf2Q4ZGD8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nxf2Q4ZGD8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nxf2Q4ZGD8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nxf2Q4ZGD8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nxf2Q4ZGD8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nxf2Q4ZGD8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nxf2Q4ZGD8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nxf2Q4ZGD8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nxf2Q4ZGD8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nxf2Q4ZGD8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nxf2Q4ZGD8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nxf2Q4ZGD8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nxf2Q4ZGD8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nxf2Q4ZGD8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nxf2Q4ZGD8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nxf2Q4ZGD8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nxf2Q4ZGD8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nxf2Q4ZGD8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nxf2Q4ZGD8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nxf2Q4ZGD8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Nxf2Q4ZGD8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nxf2Q4ZGD8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nxf2Q4ZGD8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nxf2Q4ZGD8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nxf2Q4ZGD8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nxf2Q4ZGD8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nxf2Q4ZGD8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nxf2Q4ZGD8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nxf2Q4ZGD8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nxf2Q4ZGD8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nxf2Q4ZGD8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nxf2Q4ZGD8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nxf2Q4ZGD8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nxf2Q4ZGD8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nxf2Q4ZGD8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nxf2Q4ZGD8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nxf2Q4ZGD8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nxf2Q4ZGD8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nxf2Q4ZGD8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nxf2Q4ZGD8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nxf2Q4ZGD8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nxf2Q4ZGD8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nxf2Q4ZGD8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nxf2Q4ZGD8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Nxf2Q4ZGD8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nxf2Q4ZGD8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nxf2Q4ZGD8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nxf2Q4ZGD8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nxf2Q4ZGD8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nxf2Q4ZGD8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Nxf2Q4ZGD8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms