Protein–RNA interactions for Protein: Q4U2R1

Herc2, E3 ubiquitin-protein ligase HERC2, mousemouse

Predictions only

Length 4,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc2Q4U2R1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Herc2Q4U2R1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Herc2Q4U2R1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc2Q4U2R1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc2Q4U2R1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Herc2Q4U2R1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Herc2Q4U2R1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herc2Q4U2R1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herc2Q4U2R1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herc2Q4U2R1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herc2Q4U2R1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Herc2Q4U2R1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc2Q4U2R1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc2Q4U2R1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc2Q4U2R1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc2Q4U2R1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc2Q4U2R1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc2Q4U2R1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Herc2Q4U2R1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Herc2Q4U2R1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Herc2Q4U2R1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Herc2Q4U2R1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Herc2Q4U2R1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Herc2Q4U2R1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Herc2Q4U2R1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Herc2Q4U2R1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Herc2Q4U2R1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Herc2Q4U2R1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Herc2Q4U2R1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc2Q4U2R1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc2Q4U2R1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc2Q4U2R1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc2Q4U2R1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc2Q4U2R1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herc2Q4U2R1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc2Q4U2R1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc2Q4U2R1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Herc2Q4U2R1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Herc2Q4U2R1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Herc2Q4U2R1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Herc2Q4U2R1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Herc2Q4U2R1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Herc2Q4U2R1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Herc2Q4U2R1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Herc2Q4U2R1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Herc2Q4U2R1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Herc2Q4U2R1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Herc2Q4U2R1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Herc2Q4U2R1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Herc2Q4U2R1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc2Q4U2R1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc2Q4U2R1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc2Q4U2R1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Herc2Q4U2R1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Herc2Q4U2R1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc2Q4U2R1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Herc2Q4U2R1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Herc2Q4U2R1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Herc2Q4U2R1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Herc2Q4U2R1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Herc2Q4U2R1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Herc2Q4U2R1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc2Q4U2R1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc2Q4U2R1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc2Q4U2R1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc2Q4U2R1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Herc2Q4U2R1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Herc2Q4U2R1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Herc2Q4U2R1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc2Q4U2R1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc2Q4U2R1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc2Q4U2R1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc2Q4U2R1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herc2Q4U2R1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herc2Q4U2R1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herc2Q4U2R1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc2Q4U2R1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc2Q4U2R1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herc2Q4U2R1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herc2Q4U2R1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc2Q4U2R1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc2Q4U2R1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc2Q4U2R1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc2Q4U2R1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc2Q4U2R1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herc2Q4U2R1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc2Q4U2R1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc2Q4U2R1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc2Q4U2R1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc2Q4U2R1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc2Q4U2R1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc2Q4U2R1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc2Q4U2R1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc2Q4U2R1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc2Q4U2R1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc2Q4U2R1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc2Q4U2R1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc2Q4U2R1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc2Q4U2R1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc2Q4U2R1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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