Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDD4

Arap1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arap1Q4LDD4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
Arap1Q4LDD4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Arap1Q4LDD4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Arap1Q4LDD4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
Arap1Q4LDD4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Arap1Q4LDD4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC40.4■■■■■ 4.06
Arap1Q4LDD4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Arap1Q4LDD4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
Arap1Q4LDD4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Arap1Q4LDD4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Arap1Q4LDD4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
Arap1Q4LDD4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC40.36■■■■■ 4.05
Arap1Q4LDD4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
Arap1Q4LDD4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
Arap1Q4LDD4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
Arap1Q4LDD4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Arap1Q4LDD4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC40.29■■■■■ 4.04
Arap1Q4LDD4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Arap1Q4LDD4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
Arap1Q4LDD4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Arap1Q4LDD4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
Arap1Q4LDD4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Arap1Q4LDD4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Arap1Q4LDD4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
Arap1Q4LDD4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Arap1Q4LDD4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC40.18■■■■■ 4.02
Arap1Q4LDD4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC40.18■■■■■ 4.02
Arap1Q4LDD4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
Arap1Q4LDD4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.16■■■■■ 4.02
Arap1Q4LDD4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Arap1Q4LDD4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Arap1Q4LDD4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
Arap1Q4LDD4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
Arap1Q4LDD4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
Arap1Q4LDD4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Arap1Q4LDD4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC40.11■■■■■ 4.01
Arap1Q4LDD4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Arap1Q4LDD4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
Arap1Q4LDD4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Arap1Q4LDD4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Arap1Q4LDD4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Arap1Q4LDD4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC40.02■■■■■ 4
Arap1Q4LDD4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
Arap1Q4LDD4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC40.01■■■■■ 4
Arap1Q4LDD4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Arap1Q4LDD4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
Arap1Q4LDD4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
Arap1Q4LDD4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Arap1Q4LDD4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
Arap1Q4LDD4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Arap1Q4LDD4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
Arap1Q4LDD4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Arap1Q4LDD4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
Arap1Q4LDD4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Arap1Q4LDD4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Arap1Q4LDD4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC39.9■■■■□ 3.98
Arap1Q4LDD4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
Arap1Q4LDD4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Arap1Q4LDD4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC39.88■■■■□ 3.98
Arap1Q4LDD4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Arap1Q4LDD4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Arap1Q4LDD4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Arap1Q4LDD4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Arap1Q4LDD4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Arap1Q4LDD4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC39.83■■■■□ 3.97
Arap1Q4LDD4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
Arap1Q4LDD4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
Arap1Q4LDD4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Arap1Q4LDD4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Arap1Q4LDD4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
Arap1Q4LDD4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC39.76■■■■□ 3.96
Arap1Q4LDD4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
Arap1Q4LDD4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Arap1Q4LDD4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC39.73■■■■□ 3.95
Arap1Q4LDD4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
Arap1Q4LDD4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
Arap1Q4LDD4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Arap1Q4LDD4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Arap1Q4LDD4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Arap1Q4LDD4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
Arap1Q4LDD4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Arap1Q4LDD4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
Arap1Q4LDD4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Arap1Q4LDD4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
Arap1Q4LDD4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Arap1Q4LDD4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Arap1Q4LDD4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Arap1Q4LDD4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC39.6■■■■□ 3.93
Arap1Q4LDD4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Arap1Q4LDD4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC39.59■■■■□ 3.93
Arap1Q4LDD4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
Arap1Q4LDD4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Arap1Q4LDD4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
Arap1Q4LDD4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Arap1Q4LDD4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Arap1Q4LDD4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
Arap1Q4LDD4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
Arap1Q4LDD4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC39.51■■■■□ 3.92
Arap1Q4LDD4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
Arap1Q4LDD4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms