Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pydc3Q3V3Q4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pydc3Q3V3Q4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pydc3Q3V3Q4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pydc3Q3V3Q4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pydc3Q3V3Q4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pydc3Q3V3Q4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pydc3Q3V3Q4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pydc3Q3V3Q4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pydc3Q3V3Q4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pydc3Q3V3Q4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pydc3Q3V3Q4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pydc3Q3V3Q4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pydc3Q3V3Q4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Pydc3Q3V3Q4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pydc3Q3V3Q4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pydc3Q3V3Q4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pydc3Q3V3Q4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Pydc3Q3V3Q4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pydc3Q3V3Q4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pydc3Q3V3Q4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pydc3Q3V3Q4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pydc3Q3V3Q4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pydc3Q3V3Q4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pydc3Q3V3Q4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pydc3Q3V3Q4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pydc3Q3V3Q4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pydc3Q3V3Q4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pydc3Q3V3Q4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Pydc3Q3V3Q4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pydc3Q3V3Q4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pydc3Q3V3Q4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pydc3Q3V3Q4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pydc3Q3V3Q4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pydc3Q3V3Q4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pydc3Q3V3Q4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pydc3Q3V3Q4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pydc3Q3V3Q4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pydc3Q3V3Q4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pydc3Q3V3Q4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pydc3Q3V3Q4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pydc3Q3V3Q4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pydc3Q3V3Q4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pydc3Q3V3Q4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pydc3Q3V3Q4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pydc3Q3V3Q4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pydc3Q3V3Q4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pydc3Q3V3Q4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pydc3Q3V3Q4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pydc3Q3V3Q4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pydc3Q3V3Q4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pydc3Q3V3Q4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pydc3Q3V3Q4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pydc3Q3V3Q4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pydc3Q3V3Q4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pydc3Q3V3Q4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pydc3Q3V3Q4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pydc3Q3V3Q4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pydc3Q3V3Q4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pydc3Q3V3Q4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Pydc3Q3V3Q4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pydc3Q3V3Q4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pydc3Q3V3Q4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pydc3Q3V3Q4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pydc3Q3V3Q4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pydc3Q3V3Q4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pydc3Q3V3Q4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pydc3Q3V3Q4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pydc3Q3V3Q4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pydc3Q3V3Q4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pydc3Q3V3Q4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pydc3Q3V3Q4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Pydc3Q3V3Q4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pydc3Q3V3Q4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pydc3Q3V3Q4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pydc3Q3V3Q4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pydc3Q3V3Q4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pydc3Q3V3Q4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pydc3Q3V3Q4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pydc3Q3V3Q4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pydc3Q3V3Q4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pydc3Q3V3Q4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pydc3Q3V3Q4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pydc3Q3V3Q4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pydc3Q3V3Q4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pydc3Q3V3Q4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pydc3Q3V3Q4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pydc3Q3V3Q4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pydc3Q3V3Q4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Pydc3Q3V3Q4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pydc3Q3V3Q4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pydc3Q3V3Q4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pydc3Q3V3Q4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pydc3Q3V3Q4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pydc3Q3V3Q4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pydc3Q3V3Q4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pydc3Q3V3Q4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pydc3Q3V3Q4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pydc3Q3V3Q4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pydc3Q3V3Q4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1286.2 ms