Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2G9

1810049J17Rik, RIKEN cDNA 1810049J17 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810049J17RikQ3V2G9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
1810049J17RikQ3V2G9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
1810049J17RikQ3V2G9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
1810049J17RikQ3V2G9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
1810049J17RikQ3V2G9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
1810049J17RikQ3V2G9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
1810049J17RikQ3V2G9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
1810049J17RikQ3V2G9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
1810049J17RikQ3V2G9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
1810049J17RikQ3V2G9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
1810049J17RikQ3V2G9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
1810049J17RikQ3V2G9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
1810049J17RikQ3V2G9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
1810049J17RikQ3V2G9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
1810049J17RikQ3V2G9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
1810049J17RikQ3V2G9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
1810049J17RikQ3V2G9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
1810049J17RikQ3V2G9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
1810049J17RikQ3V2G9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
1810049J17RikQ3V2G9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
1810049J17RikQ3V2G9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
1810049J17RikQ3V2G9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
1810049J17RikQ3V2G9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
1810049J17RikQ3V2G9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
1810049J17RikQ3V2G9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
1810049J17RikQ3V2G9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
1810049J17RikQ3V2G9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
1810049J17RikQ3V2G9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
1810049J17RikQ3V2G9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
1810049J17RikQ3V2G9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
1810049J17RikQ3V2G9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
1810049J17RikQ3V2G9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
1810049J17RikQ3V2G9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
1810049J17RikQ3V2G9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
1810049J17RikQ3V2G9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
1810049J17RikQ3V2G9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
1810049J17RikQ3V2G9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
1810049J17RikQ3V2G9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
1810049J17RikQ3V2G9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
1810049J17RikQ3V2G9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
1810049J17RikQ3V2G9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
1810049J17RikQ3V2G9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
1810049J17RikQ3V2G9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
1810049J17RikQ3V2G9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
1810049J17RikQ3V2G9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
1810049J17RikQ3V2G9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
1810049J17RikQ3V2G9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
1810049J17RikQ3V2G9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
1810049J17RikQ3V2G9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
1810049J17RikQ3V2G9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
1810049J17RikQ3V2G9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
1810049J17RikQ3V2G9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
1810049J17RikQ3V2G9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
1810049J17RikQ3V2G9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
1810049J17RikQ3V2G9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
1810049J17RikQ3V2G9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
1810049J17RikQ3V2G9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
1810049J17RikQ3V2G9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
1810049J17RikQ3V2G9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
1810049J17RikQ3V2G9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
1810049J17RikQ3V2G9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
1810049J17RikQ3V2G9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
1810049J17RikQ3V2G9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
1810049J17RikQ3V2G9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
1810049J17RikQ3V2G9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
1810049J17RikQ3V2G9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
1810049J17RikQ3V2G9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
1810049J17RikQ3V2G9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
1810049J17RikQ3V2G9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
1810049J17RikQ3V2G9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
1810049J17RikQ3V2G9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
1810049J17RikQ3V2G9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
1810049J17RikQ3V2G9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
1810049J17RikQ3V2G9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
1810049J17RikQ3V2G9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
1810049J17RikQ3V2G9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
1810049J17RikQ3V2G9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
1810049J17RikQ3V2G9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
1810049J17RikQ3V2G9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
1810049J17RikQ3V2G9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
1810049J17RikQ3V2G9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
1810049J17RikQ3V2G9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
1810049J17RikQ3V2G9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
1810049J17RikQ3V2G9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
1810049J17RikQ3V2G9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
1810049J17RikQ3V2G9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
1810049J17RikQ3V2G9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
1810049J17RikQ3V2G9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
1810049J17RikQ3V2G9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
1810049J17RikQ3V2G9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
1810049J17RikQ3V2G9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
1810049J17RikQ3V2G9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
1810049J17RikQ3V2G9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
1810049J17RikQ3V2G9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
1810049J17RikQ3V2G9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
1810049J17RikQ3V2G9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
1810049J17RikQ3V2G9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
1810049J17RikQ3V2G9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
1810049J17RikQ3V2G9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
1810049J17RikQ3V2G9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms