Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm44Q3V089 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm44Q3V089 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm44Q3V089 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm44Q3V089 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbm44Q3V089 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbm44Q3V089 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbm44Q3V089 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbm44Q3V089 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbm44Q3V089 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbm44Q3V089 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbm44Q3V089 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbm44Q3V089 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbm44Q3V089 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbm44Q3V089 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbm44Q3V089 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbm44Q3V089 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rbm44Q3V089 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbm44Q3V089 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbm44Q3V089 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbm44Q3V089 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbm44Q3V089 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbm44Q3V089 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rbm44Q3V089 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rbm44Q3V089 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rbm44Q3V089 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rbm44Q3V089 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rbm44Q3V089 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbm44Q3V089 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbm44Q3V089 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbm44Q3V089 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbm44Q3V089 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbm44Q3V089 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbm44Q3V089 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbm44Q3V089 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbm44Q3V089 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbm44Q3V089 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbm44Q3V089 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbm44Q3V089 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbm44Q3V089 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbm44Q3V089 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbm44Q3V089 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbm44Q3V089 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbm44Q3V089 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbm44Q3V089 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbm44Q3V089 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbm44Q3V089 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbm44Q3V089 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbm44Q3V089 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rbm44Q3V089 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rbm44Q3V089 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rbm44Q3V089 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbm44Q3V089 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbm44Q3V089 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbm44Q3V089 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbm44Q3V089 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbm44Q3V089 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbm44Q3V089 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbm44Q3V089 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rbm44Q3V089 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rbm44Q3V089 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbm44Q3V089 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rbm44Q3V089 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Rbm44Q3V089 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbm44Q3V089 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbm44Q3V089 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rbm44Q3V089 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rbm44Q3V089 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rbm44Q3V089 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rbm44Q3V089 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rbm44Q3V089 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rbm44Q3V089 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rbm44Q3V089 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rbm44Q3V089 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbm44Q3V089 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbm44Q3V089 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbm44Q3V089 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rbm44Q3V089 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbm44Q3V089 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbm44Q3V089 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbm44Q3V089 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbm44Q3V089 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rbm44Q3V089 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rbm44Q3V089 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbm44Q3V089 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rbm44Q3V089 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rbm44Q3V089 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rbm44Q3V089 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rbm44Q3V089 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rbm44Q3V089 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rbm44Q3V089 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rbm44Q3V089 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rbm44Q3V089 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rbm44Q3V089 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rbm44Q3V089 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rbm44Q3V089 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rbm44Q3V089 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rbm44Q3V089 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rbm44Q3V089 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rbm44Q3V089 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
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