Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmed1Q3V009 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmed1Q3V009 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmed1Q3V009 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmed1Q3V009 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmed1Q3V009 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tmed1Q3V009 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmed1Q3V009 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmed1Q3V009 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmed1Q3V009 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmed1Q3V009 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmed1Q3V009 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmed1Q3V009 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmed1Q3V009 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmed1Q3V009 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmed1Q3V009 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmed1Q3V009 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmed1Q3V009 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmed1Q3V009 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmed1Q3V009 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmed1Q3V009 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmed1Q3V009 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmed1Q3V009 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmed1Q3V009 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmed1Q3V009 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmed1Q3V009 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmed1Q3V009 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmed1Q3V009 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmed1Q3V009 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tmed1Q3V009 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tmed1Q3V009 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmed1Q3V009 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmed1Q3V009 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmed1Q3V009 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmed1Q3V009 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmed1Q3V009 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmed1Q3V009 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmed1Q3V009 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmed1Q3V009 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmed1Q3V009 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmed1Q3V009 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmed1Q3V009 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmed1Q3V009 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmed1Q3V009 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmed1Q3V009 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tmed1Q3V009 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmed1Q3V009 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmed1Q3V009 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmed1Q3V009 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmed1Q3V009 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmed1Q3V009 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmed1Q3V009 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmed1Q3V009 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmed1Q3V009 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmed1Q3V009 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmed1Q3V009 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tmed1Q3V009 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmed1Q3V009 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmed1Q3V009 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmed1Q3V009 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmed1Q3V009 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmed1Q3V009 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmed1Q3V009 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmed1Q3V009 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmed1Q3V009 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmed1Q3V009 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmed1Q3V009 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmed1Q3V009 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmed1Q3V009 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmed1Q3V009 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmed1Q3V009 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmed1Q3V009 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tmed1Q3V009 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Tmed1Q3V009 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmed1Q3V009 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmed1Q3V009 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmed1Q3V009 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmed1Q3V009 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmed1Q3V009 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmed1Q3V009 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmed1Q3V009 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmed1Q3V009 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmed1Q3V009 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmed1Q3V009 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmed1Q3V009 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmed1Q3V009 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmed1Q3V009 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmed1Q3V009 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmed1Q3V009 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmed1Q3V009 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmed1Q3V009 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmed1Q3V009 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmed1Q3V009 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmed1Q3V009 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmed1Q3V009 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmed1Q3V009 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmed1Q3V009 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmed1Q3V009 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmed1Q3V009 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmed1Q3V009 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms