Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16,6■□□□□ 0,25
SvipQ3UZP4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,6■□□□□ 0,25
SvipQ3UZP4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,59■□□□□ 0,25
SvipQ3UZP4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC16,58■□□□□ 0,25
SvipQ3UZP4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,58■□□□□ 0,24
SvipQ3UZP4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,57■□□□□ 0,24
SvipQ3UZP4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,57■□□□□ 0,24
SvipQ3UZP4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16,57■□□□□ 0,24
SvipQ3UZP4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16,56■□□□□ 0,24
SvipQ3UZP4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16,56■□□□□ 0,24
SvipQ3UZP4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC16,56■□□□□ 0,24
SvipQ3UZP4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,55■□□□□ 0,24
SvipQ3UZP4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16,55■□□□□ 0,24
SvipQ3UZP4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,55■□□□□ 0,24
SvipQ3UZP4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,55■□□□□ 0,24
SvipQ3UZP4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16,54■□□□□ 0,24
SvipQ3UZP4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,53■□□□□ 0,24
SvipQ3UZP4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16,52■□□□□ 0,24
SvipQ3UZP4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16,52■□□□□ 0,24
SvipQ3UZP4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,52■□□□□ 0,23
SvipQ3UZP4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC16,51■□□□□ 0,23
SvipQ3UZP4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16,51■□□□□ 0,23
SvipQ3UZP4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,51■□□□□ 0,23
SvipQ3UZP4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16,5■□□□□ 0,23
SvipQ3UZP4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,5■□□□□ 0,23
SvipQ3UZP4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16,5■□□□□ 0,23
SvipQ3UZP4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,5■□□□□ 0,23
SvipQ3UZP4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,5■□□□□ 0,23
SvipQ3UZP4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,5■□□□□ 0,23
SvipQ3UZP4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16,49■□□□□ 0,23
SvipQ3UZP4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16,48■□□□□ 0,23
SvipQ3UZP4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,48■□□□□ 0,23
SvipQ3UZP4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16,48■□□□□ 0,23
SvipQ3UZP4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16,47■□□□□ 0,23
SvipQ3UZP4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,47■□□□□ 0,23
SvipQ3UZP4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,47■□□□□ 0,23
SvipQ3UZP4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16,47■□□□□ 0,23
SvipQ3UZP4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,45■□□□□ 0,22
SvipQ3UZP4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,45■□□□□ 0,22
SvipQ3UZP4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,45■□□□□ 0,22
SvipQ3UZP4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16,45■□□□□ 0,22
SvipQ3UZP4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16,43■□□□□ 0,22
SvipQ3UZP4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16,42■□□□□ 0,22
SvipQ3UZP4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,42■□□□□ 0,22
SvipQ3UZP4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,42■□□□□ 0,22
SvipQ3UZP4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,41■□□□□ 0,22
SvipQ3UZP4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,41■□□□□ 0,22
SvipQ3UZP4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,41■□□□□ 0,22
SvipQ3UZP4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16,4■□□□□ 0,22
SvipQ3UZP4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,4■□□□□ 0,22
SvipQ3UZP4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,4■□□□□ 0,22
SvipQ3UZP4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16,39■□□□□ 0,21
SvipQ3UZP4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,39■□□□□ 0,21
SvipQ3UZP4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,38■□□□□ 0,21
SvipQ3UZP4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16,38■□□□□ 0,21
SvipQ3UZP4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,38■□□□□ 0,21
SvipQ3UZP4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16,38■□□□□ 0,21
SvipQ3UZP4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16,37■□□□□ 0,21
SvipQ3UZP4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16,37■□□□□ 0,21
SvipQ3UZP4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16,37■□□□□ 0,21
SvipQ3UZP4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16,37■□□□□ 0,21
SvipQ3UZP4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,36■□□□□ 0,21
SvipQ3UZP4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,35■□□□□ 0,21
SvipQ3UZP4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,35■□□□□ 0,21
SvipQ3UZP4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,35■□□□□ 0,21
SvipQ3UZP4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,35■□□□□ 0,21
SvipQ3UZP4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,34■□□□□ 0,21
SvipQ3UZP4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,34■□□□□ 0,21
SvipQ3UZP4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,33■□□□□ 0,2
SvipQ3UZP4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16,33■□□□□ 0,2
SvipQ3UZP4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,33■□□□□ 0,2
SvipQ3UZP4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16,33■□□□□ 0,2
SvipQ3UZP4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,32■□□□□ 0,2
SvipQ3UZP4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,32■□□□□ 0,2
SvipQ3UZP4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,32■□□□□ 0,2
SvipQ3UZP4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,32■□□□□ 0,2
SvipQ3UZP4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,32■□□□□ 0,2
SvipQ3UZP4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16,32■□□□□ 0,2
SvipQ3UZP4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,32■□□□□ 0,2
SvipQ3UZP4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,31■□□□□ 0,2
SvipQ3UZP4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,31■□□□□ 0,2
SvipQ3UZP4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,31■□□□□ 0,2
SvipQ3UZP4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16,3■□□□□ 0,2
SvipQ3UZP4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16,3■□□□□ 0,2
SvipQ3UZP4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16,29■□□□□ 0,2
SvipQ3UZP4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16,29■□□□□ 0,2
SvipQ3UZP4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,27■□□□□ 0,2
SvipQ3UZP4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16,27■□□□□ 0,19
SvipQ3UZP4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,27■□□□□ 0,19
SvipQ3UZP4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16,26■□□□□ 0,19
SvipQ3UZP4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,26■□□□□ 0,19
SvipQ3UZP4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16,26■□□□□ 0,19
SvipQ3UZP4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,26■□□□□ 0,19
SvipQ3UZP4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,26■□□□□ 0,19
SvipQ3UZP4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,26■□□□□ 0,19
SvipQ3UZP4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,26■□□□□ 0,19
SvipQ3UZP4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,25■□□□□ 0,19
SvipQ3UZP4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,25■□□□□ 0,19
SvipQ3UZP4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,25■□□□□ 0,19
SvipQ3UZP4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,25■□□□□ 0,19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,6 ms