Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syndig1lQ3USQ7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syndig1lQ3USQ7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syndig1lQ3USQ7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syndig1lQ3USQ7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Syndig1lQ3USQ7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Syndig1lQ3USQ7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Syndig1lQ3USQ7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Syndig1lQ3USQ7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Syndig1lQ3USQ7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Syndig1lQ3USQ7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syndig1lQ3USQ7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syndig1lQ3USQ7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syndig1lQ3USQ7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syndig1lQ3USQ7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syndig1lQ3USQ7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syndig1lQ3USQ7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syndig1lQ3USQ7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syndig1lQ3USQ7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Syndig1lQ3USQ7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Syndig1lQ3USQ7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Syndig1lQ3USQ7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syndig1lQ3USQ7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syndig1lQ3USQ7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syndig1lQ3USQ7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syndig1lQ3USQ7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syndig1lQ3USQ7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syndig1lQ3USQ7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Syndig1lQ3USQ7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Syndig1lQ3USQ7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syndig1lQ3USQ7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Syndig1lQ3USQ7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Syndig1lQ3USQ7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Syndig1lQ3USQ7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syndig1lQ3USQ7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syndig1lQ3USQ7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Syndig1lQ3USQ7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Syndig1lQ3USQ7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syndig1lQ3USQ7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syndig1lQ3USQ7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Syndig1lQ3USQ7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Syndig1lQ3USQ7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syndig1lQ3USQ7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Syndig1lQ3USQ7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syndig1lQ3USQ7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syndig1lQ3USQ7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syndig1lQ3USQ7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syndig1lQ3USQ7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syndig1lQ3USQ7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syndig1lQ3USQ7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syndig1lQ3USQ7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syndig1lQ3USQ7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Syndig1lQ3USQ7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syndig1lQ3USQ7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syndig1lQ3USQ7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syndig1lQ3USQ7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syndig1lQ3USQ7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syndig1lQ3USQ7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syndig1lQ3USQ7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syndig1lQ3USQ7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syndig1lQ3USQ7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syndig1lQ3USQ7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syndig1lQ3USQ7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syndig1lQ3USQ7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syndig1lQ3USQ7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Syndig1lQ3USQ7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Syndig1lQ3USQ7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Syndig1lQ3USQ7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syndig1lQ3USQ7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syndig1lQ3USQ7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syndig1lQ3USQ7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syndig1lQ3USQ7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syndig1lQ3USQ7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syndig1lQ3USQ7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Syndig1lQ3USQ7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Syndig1lQ3USQ7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Syndig1lQ3USQ7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Syndig1lQ3USQ7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Syndig1lQ3USQ7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Syndig1lQ3USQ7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Syndig1lQ3USQ7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syndig1lQ3USQ7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syndig1lQ3USQ7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syndig1lQ3USQ7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syndig1lQ3USQ7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syndig1lQ3USQ7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syndig1lQ3USQ7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Syndig1lQ3USQ7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Syndig1lQ3USQ7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Syndig1lQ3USQ7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Syndig1lQ3USQ7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syndig1lQ3USQ7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syndig1lQ3USQ7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syndig1lQ3USQ7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syndig1lQ3USQ7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syndig1lQ3USQ7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syndig1lQ3USQ7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syndig1lQ3USQ7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syndig1lQ3USQ7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Syndig1lQ3USQ7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms