Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CrxosQ3UL53 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CrxosQ3UL53 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CrxosQ3UL53 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CrxosQ3UL53 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CrxosQ3UL53 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CrxosQ3UL53 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CrxosQ3UL53 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CrxosQ3UL53 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CrxosQ3UL53 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CrxosQ3UL53 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CrxosQ3UL53 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CrxosQ3UL53 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CrxosQ3UL53 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CrxosQ3UL53 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CrxosQ3UL53 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CrxosQ3UL53 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CrxosQ3UL53 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CrxosQ3UL53 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CrxosQ3UL53 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CrxosQ3UL53 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CrxosQ3UL53 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CrxosQ3UL53 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CrxosQ3UL53 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CrxosQ3UL53 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CrxosQ3UL53 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CrxosQ3UL53 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CrxosQ3UL53 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CrxosQ3UL53 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CrxosQ3UL53 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CrxosQ3UL53 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CrxosQ3UL53 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CrxosQ3UL53 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CrxosQ3UL53 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CrxosQ3UL53 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CrxosQ3UL53 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CrxosQ3UL53 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CrxosQ3UL53 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CrxosQ3UL53 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CrxosQ3UL53 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CrxosQ3UL53 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CrxosQ3UL53 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CrxosQ3UL53 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CrxosQ3UL53 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CrxosQ3UL53 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CrxosQ3UL53 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CrxosQ3UL53 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CrxosQ3UL53 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CrxosQ3UL53 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CrxosQ3UL53 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CrxosQ3UL53 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CrxosQ3UL53 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CrxosQ3UL53 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CrxosQ3UL53 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CrxosQ3UL53 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CrxosQ3UL53 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CrxosQ3UL53 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CrxosQ3UL53 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CrxosQ3UL53 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CrxosQ3UL53 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CrxosQ3UL53 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CrxosQ3UL53 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CrxosQ3UL53 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CrxosQ3UL53 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CrxosQ3UL53 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CrxosQ3UL53 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CrxosQ3UL53 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CrxosQ3UL53 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CrxosQ3UL53 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CrxosQ3UL53 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CrxosQ3UL53 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CrxosQ3UL53 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CrxosQ3UL53 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CrxosQ3UL53 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CrxosQ3UL53 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CrxosQ3UL53 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CrxosQ3UL53 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CrxosQ3UL53 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CrxosQ3UL53 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CrxosQ3UL53 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CrxosQ3UL53 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CrxosQ3UL53 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CrxosQ3UL53 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CrxosQ3UL53 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CrxosQ3UL53 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CrxosQ3UL53 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CrxosQ3UL53 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CrxosQ3UL53 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CrxosQ3UL53 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CrxosQ3UL53 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CrxosQ3UL53 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CrxosQ3UL53 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CrxosQ3UL53 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CrxosQ3UL53 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CrxosQ3UL53 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CrxosQ3UL53 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CrxosQ3UL53 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CrxosQ3UL53 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CrxosQ3UL53 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CrxosQ3UL53 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms