Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKK2

Ceacam5, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5, mousemouse

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam5Q3UKK2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ceacam5Q3UKK2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ceacam5Q3UKK2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ceacam5Q3UKK2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ceacam5Q3UKK2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ceacam5Q3UKK2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ceacam5Q3UKK2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ceacam5Q3UKK2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ceacam5Q3UKK2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ceacam5Q3UKK2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ceacam5Q3UKK2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ceacam5Q3UKK2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ceacam5Q3UKK2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ceacam5Q3UKK2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ceacam5Q3UKK2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ceacam5Q3UKK2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ceacam5Q3UKK2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ceacam5Q3UKK2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ceacam5Q3UKK2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ceacam5Q3UKK2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ceacam5Q3UKK2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ceacam5Q3UKK2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ceacam5Q3UKK2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ceacam5Q3UKK2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ceacam5Q3UKK2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ceacam5Q3UKK2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ceacam5Q3UKK2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ceacam5Q3UKK2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ceacam5Q3UKK2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ceacam5Q3UKK2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ceacam5Q3UKK2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ceacam5Q3UKK2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ceacam5Q3UKK2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ceacam5Q3UKK2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ceacam5Q3UKK2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ceacam5Q3UKK2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ceacam5Q3UKK2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ceacam5Q3UKK2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ceacam5Q3UKK2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ceacam5Q3UKK2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ceacam5Q3UKK2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ceacam5Q3UKK2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ceacam5Q3UKK2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ceacam5Q3UKK2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ceacam5Q3UKK2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ceacam5Q3UKK2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ceacam5Q3UKK2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ceacam5Q3UKK2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ceacam5Q3UKK2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ceacam5Q3UKK2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ceacam5Q3UKK2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Ceacam5Q3UKK2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ceacam5Q3UKK2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ceacam5Q3UKK2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ceacam5Q3UKK2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ceacam5Q3UKK2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ceacam5Q3UKK2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ceacam5Q3UKK2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ceacam5Q3UKK2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ceacam5Q3UKK2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ceacam5Q3UKK2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ceacam5Q3UKK2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ceacam5Q3UKK2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ceacam5Q3UKK2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ceacam5Q3UKK2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ceacam5Q3UKK2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ceacam5Q3UKK2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ceacam5Q3UKK2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ceacam5Q3UKK2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ceacam5Q3UKK2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ceacam5Q3UKK2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ceacam5Q3UKK2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ceacam5Q3UKK2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ceacam5Q3UKK2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ceacam5Q3UKK2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ceacam5Q3UKK2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ceacam5Q3UKK2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ceacam5Q3UKK2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ceacam5Q3UKK2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ceacam5Q3UKK2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ceacam5Q3UKK2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ceacam5Q3UKK2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ceacam5Q3UKK2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ceacam5Q3UKK2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ceacam5Q3UKK2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ceacam5Q3UKK2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ceacam5Q3UKK2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ceacam5Q3UKK2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ceacam5Q3UKK2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ceacam5Q3UKK2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ceacam5Q3UKK2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ceacam5Q3UKK2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ceacam5Q3UKK2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ceacam5Q3UKK2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ceacam5Q3UKK2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ceacam5Q3UKK2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ceacam5Q3UKK2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ceacam5Q3UKK2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ceacam5Q3UKK2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ceacam5Q3UKK2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms