Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI4

Tmed8, Protein TMED8, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed8Q3UHI4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Tmed8Q3UHI4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Tmed8Q3UHI4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Tmed8Q3UHI4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Tmed8Q3UHI4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Tmed8Q3UHI4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Tmed8Q3UHI4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Tmed8Q3UHI4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Tmed8Q3UHI4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Tmed8Q3UHI4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Tmed8Q3UHI4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Tmed8Q3UHI4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Tmed8Q3UHI4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Tmed8Q3UHI4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Tmed8Q3UHI4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Tmed8Q3UHI4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Tmed8Q3UHI4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Tmed8Q3UHI4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Tmed8Q3UHI4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Tmed8Q3UHI4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Tmed8Q3UHI4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Tmed8Q3UHI4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Tmed8Q3UHI4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Tmed8Q3UHI4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Tmed8Q3UHI4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Tmed8Q3UHI4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Tmed8Q3UHI4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Tmed8Q3UHI4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Tmed8Q3UHI4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tmed8Q3UHI4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Tmed8Q3UHI4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tmed8Q3UHI4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Tmed8Q3UHI4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Tmed8Q3UHI4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Tmed8Q3UHI4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tmed8Q3UHI4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tmed8Q3UHI4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tmed8Q3UHI4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tmed8Q3UHI4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tmed8Q3UHI4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tmed8Q3UHI4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tmed8Q3UHI4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Tmed8Q3UHI4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tmed8Q3UHI4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tmed8Q3UHI4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tmed8Q3UHI4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tmed8Q3UHI4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tmed8Q3UHI4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tmed8Q3UHI4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Tmed8Q3UHI4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Tmed8Q3UHI4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
Tmed8Q3UHI4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Tmed8Q3UHI4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
Tmed8Q3UHI4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Tmed8Q3UHI4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Tmed8Q3UHI4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Tmed8Q3UHI4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Tmed8Q3UHI4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Tmed8Q3UHI4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Tmed8Q3UHI4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Tmed8Q3UHI4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Tmed8Q3UHI4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Tmed8Q3UHI4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Tmed8Q3UHI4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Tmed8Q3UHI4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Tmed8Q3UHI4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tmed8Q3UHI4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Tmed8Q3UHI4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Tmed8Q3UHI4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Tmed8Q3UHI4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Tmed8Q3UHI4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Tmed8Q3UHI4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Tmed8Q3UHI4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Tmed8Q3UHI4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Tmed8Q3UHI4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tmed8Q3UHI4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Tmed8Q3UHI4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tmed8Q3UHI4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tmed8Q3UHI4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Tmed8Q3UHI4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tmed8Q3UHI4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tmed8Q3UHI4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tmed8Q3UHI4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tmed8Q3UHI4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tmed8Q3UHI4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Tmed8Q3UHI4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tmed8Q3UHI4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tmed8Q3UHI4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tmed8Q3UHI4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tmed8Q3UHI4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tmed8Q3UHI4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Tmed8Q3UHI4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tmed8Q3UHI4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Tmed8Q3UHI4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Tmed8Q3UHI4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Tmed8Q3UHI4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Tmed8Q3UHI4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Tmed8Q3UHI4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Tmed8Q3UHI4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Tmed8Q3UHI4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms