Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHA3

Spg11, Spatacsin, mousemouse

Predictions only

Length 2,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spg11Q3UHA3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Spg11Q3UHA3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Spg11Q3UHA3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Spg11Q3UHA3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Spg11Q3UHA3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Spg11Q3UHA3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Spg11Q3UHA3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Spg11Q3UHA3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Spg11Q3UHA3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Spg11Q3UHA3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Spg11Q3UHA3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Spg11Q3UHA3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Spg11Q3UHA3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Spg11Q3UHA3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Spg11Q3UHA3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Spg11Q3UHA3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Spg11Q3UHA3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Spg11Q3UHA3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Spg11Q3UHA3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Spg11Q3UHA3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Spg11Q3UHA3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Spg11Q3UHA3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Spg11Q3UHA3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Spg11Q3UHA3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Spg11Q3UHA3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Spg11Q3UHA3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Spg11Q3UHA3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Spg11Q3UHA3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Spg11Q3UHA3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Spg11Q3UHA3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Spg11Q3UHA3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Spg11Q3UHA3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Spg11Q3UHA3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Spg11Q3UHA3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Spg11Q3UHA3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Spg11Q3UHA3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Spg11Q3UHA3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Spg11Q3UHA3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Spg11Q3UHA3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Spg11Q3UHA3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Spg11Q3UHA3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Spg11Q3UHA3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Spg11Q3UHA3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Spg11Q3UHA3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Spg11Q3UHA3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Spg11Q3UHA3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Spg11Q3UHA3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Spg11Q3UHA3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Spg11Q3UHA3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Spg11Q3UHA3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Spg11Q3UHA3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Spg11Q3UHA3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Spg11Q3UHA3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Spg11Q3UHA3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Spg11Q3UHA3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Spg11Q3UHA3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Spg11Q3UHA3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spg11Q3UHA3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spg11Q3UHA3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spg11Q3UHA3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spg11Q3UHA3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spg11Q3UHA3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spg11Q3UHA3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spg11Q3UHA3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Spg11Q3UHA3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spg11Q3UHA3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spg11Q3UHA3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spg11Q3UHA3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spg11Q3UHA3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Spg11Q3UHA3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spg11Q3UHA3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spg11Q3UHA3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spg11Q3UHA3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spg11Q3UHA3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Spg11Q3UHA3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Spg11Q3UHA3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spg11Q3UHA3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Spg11Q3UHA3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spg11Q3UHA3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spg11Q3UHA3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spg11Q3UHA3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spg11Q3UHA3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Spg11Q3UHA3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spg11Q3UHA3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spg11Q3UHA3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spg11Q3UHA3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spg11Q3UHA3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Spg11Q3UHA3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spg11Q3UHA3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spg11Q3UHA3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spg11Q3UHA3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spg11Q3UHA3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spg11Q3UHA3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Spg11Q3UHA3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spg11Q3UHA3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Spg11Q3UHA3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Spg11Q3UHA3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Spg11Q3UHA3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spg11Q3UHA3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spg11Q3UHA3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms