Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trip13Q3UA06 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trip13Q3UA06 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trip13Q3UA06 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trip13Q3UA06 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trip13Q3UA06 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trip13Q3UA06 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trip13Q3UA06 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Trip13Q3UA06 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trip13Q3UA06 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trip13Q3UA06 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trip13Q3UA06 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trip13Q3UA06 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trip13Q3UA06 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trip13Q3UA06 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trip13Q3UA06 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trip13Q3UA06 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trip13Q3UA06 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Trip13Q3UA06 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trip13Q3UA06 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trip13Q3UA06 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trip13Q3UA06 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trip13Q3UA06 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trip13Q3UA06 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trip13Q3UA06 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trip13Q3UA06 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trip13Q3UA06 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trip13Q3UA06 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trip13Q3UA06 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trip13Q3UA06 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trip13Q3UA06 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trip13Q3UA06 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trip13Q3UA06 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trip13Q3UA06 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trip13Q3UA06 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trip13Q3UA06 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trip13Q3UA06 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trip13Q3UA06 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trip13Q3UA06 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trip13Q3UA06 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Trip13Q3UA06 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trip13Q3UA06 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trip13Q3UA06 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trip13Q3UA06 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trip13Q3UA06 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trip13Q3UA06 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Trip13Q3UA06 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trip13Q3UA06 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trip13Q3UA06 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trip13Q3UA06 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Trip13Q3UA06 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trip13Q3UA06 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trip13Q3UA06 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trip13Q3UA06 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trip13Q3UA06 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trip13Q3UA06 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trip13Q3UA06 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trip13Q3UA06 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trip13Q3UA06 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trip13Q3UA06 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trip13Q3UA06 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Trip13Q3UA06 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trip13Q3UA06 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trip13Q3UA06 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trip13Q3UA06 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trip13Q3UA06 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trip13Q3UA06 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trip13Q3UA06 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trip13Q3UA06 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trip13Q3UA06 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trip13Q3UA06 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trip13Q3UA06 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trip13Q3UA06 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trip13Q3UA06 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trip13Q3UA06 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trip13Q3UA06 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trip13Q3UA06 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trip13Q3UA06 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trip13Q3UA06 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trip13Q3UA06 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trip13Q3UA06 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trip13Q3UA06 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trip13Q3UA06 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trip13Q3UA06 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trip13Q3UA06 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trip13Q3UA06 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trip13Q3UA06 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trip13Q3UA06 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trip13Q3UA06 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trip13Q3UA06 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trip13Q3UA06 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trip13Q3UA06 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trip13Q3UA06 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trip13Q3UA06 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trip13Q3UA06 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trip13Q3UA06 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trip13Q3UA06 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trip13Q3UA06 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trip13Q3UA06 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trip13Q3UA06 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms